Akkermansia muciniphila在肠道消化模拟系统中的变化与意义.docx
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1、Akkermansiamuciniphila定植在人类肠道黏液层,是可特异性降解黏蛋白的革兰氏阴性严格厌氧菌。Amuciniphila作为偏好定植在肠道黏液层中的细菌,既降解黏蛋白维持自身丰度,又刺激机体黏液层增厚,维持机体健康状况。有报道发现A.muciniphila的丰度在患肠道紊乱或某类疾病的人群中较低,其定植情况是机体健康水平的标志之一。越来越多的研究证明A.muciniphila在人体肠道中具有重要的功能性,但是有部分人群肠道中A.muciniphila的丰度可能较低,甚至没有定植。因地域不同,人群居住的环境和饮食结构存在差异,可能对A.muciniphila定植率存在影响。根据以上
2、研究成果,提出对应的假设:中国人群的A.muciniphila定植率可能低于国外人群,因此需要通过一些方式去改变现状。通过收集地区健康的成年人体粪便,分析A.muciniphila的定植情况;将团队设计的符合东方人饮食习惯的人体胃肠道微生态消化做拟系统为研究基础,选择3个无A.muciniphila定植的志愿者粪便为接种物,进行IX108CFUmL丰度的A.muciniphila干预,通过宏基因组测序技术联合实时聚合酶链式反应(real-timePCR)系统研究A.muciniphila的干预所引起的肠道菌群变化。A.muciniphila定植情况分析经过real-timePCR分析,在131
3、人中有117人A.muciniphila定植阳性,定植率为89.31%,A.muciniphila定植平均丰度为5.825(Ig(CFUZmD)o菌属的real-timePCR标准曲线总菌属标准曲线的菌落计数为4.52xlO9CFUmL,扩增效率为92.039%,标准曲线拟合度R2为0.999;Bifidobacterium标准曲线的菌落计数为2.56108CFUmL,扩增效率为90.509%,标准曲线拟合度R2为0.991;Lactobacillus标准曲线的菌落计数为4.74109CFUmL,扩增效率为97.251%,标准曲线拟合度R2为0.995;Bacteroides标准曲线的菌落计数
4、为5.645108CFUmL,扩增效率为105.919%,标准曲线拟合度R2为0.997;AkkermanSia标准曲线的菌落计数为3.84xlO8CFUmL,扩增效率为94.859%,标准曲线拟合度R2为1.0,所有菌属系数均为合理范围内,具有定量意义。不同菌属real-timePCR定量结果结果显示,与接种液中的总菌属比较,所有组的总菌属在14h后丰度呈现显著性下降,说明营养物质开始出现不足。对照组的A.muciniphila未检测出,说明志愿者的粪便中不含A.muciniphila定植,即使在检测限外的丰度也不会出现大量增长;实验组(Al、A2)的A.muciniphila在14h前保持
5、初始的高丰度(7(lg(CFUZmD)以上),以及出现少量增长,说明A.muciniphila可以在肠道菌群环境中维持生长。实验组(Al、A2)的BaCterOideS属与BifidobaCteriUm属丰度均不断下降,说明A.muciniphila的加入可能增加了两者的生存压力;对照组的Bifidobacterium属的丰度出现波动性上升,说明无A.muciniphila的存在对其生长抑制性较小。在14h前,实验组的LaCtobaCilIUS属的丰度均出现上升,但对照组的丰度降低,说明A.muciniphila可能对Lactobacillus属具有促进生长的作用。发酵液16SrDNA测序分析
6、y 7 yEscherichia Shigclla Dialixter Bactcmidcs EntcrtKiHCUs PrGOfdIa 9AlloprexotellaSuMohranuhtmLachwspiraLck hntjspir(K eae NK4136 group r.ar-J LiK jwj SyiterclfaEulvnufn nufunantiuni gnp lii/iJobactcrmm .RuiuMMKuccacvac UCG 002RUmnXKPCeUWaC UCG 013ParabactcroidesSfeptuciKCUSClostndium SenSU Strict
7、o 1Lac IuhiKiIIits i ahb(icumRiifiHnococcaccac NK4A2I4 groupAlistpLaChnod3lrUhmCllinella Lad(Hwcu Flaonifntr ROmhOMHa OiknihiHier AIhSneHu Haenuhilus HoldemanellaOOO0.010.153.6295.93超府王国/%由样本菌属水平分析(图2)可知,实验组的BaCterOideS属均总体呈现下降的趋势,对照组的24h的Bacteroides呈现小幅上升,结果与real-timePCR的分析相匹配;24h,实验组AI和A2的Lactobac
8、illus属丰度比对照组要高,而Bifidobacterium属要低于对照组,整体趋势与real-timePCR的分析相似。 EnteroctHCUxJaetatis Streifloctusallo/viicnsuhsp.ntacLJactis和Ljohnsonii呈现增殖,趋势与real-timePCR的检测结果匹配。对照组因为无明显优势菌群的存在,可能使容易生存的菌种生长较快,如E.faecalis和S.gallolyticus,让营养来源单一的菌种逐渐衰亡,如OscillospiraceaebacteriumVE202_24oOscillospiraceaebacterium主要吸收宿
9、主聚糖存活,而发酵液中的关键营养成分为MUCin,结构中有大部分为聚糖,但因A.muciniphila的干预使黏蛋白大量消耗,因此可能使这类菌种营养物质匮乏。主坐标分析从图4可知,按照时间点分组,2、14h和24h的空间距离较大,显示样本群的差异较大;按照实验组和对照组分析,组间距离较小,相同时间点的样本聚在一起,显示其差异较小。因此在菌落总体结构上,A.muciniphila添加后对肠道微生态的结构无显著影响,说明其对肠道菌群组成没有破坏性。结论与讨论在地区人群的A.muciniphila定植率为89.31%,平均丰度为5.825(Ig(CFUmL)o肠道消化模拟不同时间点的real-tim
10、ePCR结果显示,A.muciniphila在模拟人类肠道微生物菌群环境中具备生存能力;对Bifidobacterium属和BaCteroideS属具有抑制效果,对LaCtObaCilhIS属具有促进作用。16SrDNA基因组测序结果显示:实验组L.lactis、S.gallolyticussubsp.macedonicus相对丰度均呈现增长,OscillospiraceaebacteriumVE202-24相对丰度大幅降低,Lachnospiraceaebacterium615相对丰度较为稳定;在菌落总体结构上,A.muciniphila添加后对肠道微生物菌群的结构无显著影响,说明其对肠道菌
11、群组成没有破坏性。本研究选择无A.muciniphila定植的肠道菌群作为接种液,再添加一定丰度的A.muciniphila活菌进行干预,但有报道表明1%5%为接近最健康人群的丰度。这是本研究疏漏的一个需要探究的点,未来将进行改进。本研究采用时长为24h的肠道消化模拟系统,仅能作为参考评估A.muciniphila对肠道菌群的作用。今后应设置长时间段的评估实验,其中包括35d的菌群稳定期和7d以上的长期定植评估等。本研究中,A.muciniphila添加到新的肠道微生物菌群中,可能增加了营养物质的消耗,尤其是黏蛋白的利用,使需要黏蛋白作为能源的菌群生长受到抑制。在14h后总菌数出现大幅下降,说
12、明营养物质开始缺乏,使营养要求不高的肠道菌群丰度出现额外的增长,生存竞争能力较强;16SrDNA基因组测序结果显示14h后ESCheriChiaShigeIla属出现明显增长,可能对其他菌属有限制或竞争作用,影响菌群的结构组成。但由总体菌落结构可知,Amuciniphila的添加对肠道微生物菌群的结构无显著性破坏作用,表明其可能具备活菌摄入的基本要求。对于低丰度或无A.muciniphila定植的人群,需找出对应的合理方式帮助A.muciniphila定植或者大量增-良。利用体外肠道消化系统探究A.muciniphila在肠道中初次定植更具有参考价值。本研究完成A.muciniphila在人体
13、肠道微生态的变化评估,还需对体内进一步深入研究,因此将此类肠道微生态移殖到无菌动物模型中,再摄入A.muciniphila活菌可能更具合理性,这也是本团队后续的研究工作之一。肠道重要菌属AkkermansiaMuciniphila,它如何保护肠道健康嗜粘蛋白-阿克曼氏菌(Akkermansiamuciniphila,A.muciniphila),简称为AKK,于2004年发现,是一种从人类粪便中分离出来的椭圆形革兰氏阴性细菌。该细菌以荷兰微生物生态学家AntonDLAkkennans的名字命名,以表彰他对该领域的贡献。A.muciniphila是人类肠道共生菌,并可以依靠肠粘液层的黏蛋白生存。
14、在过去十年中,越来越多的研究证明,在糖尿病、心血管疾病、疾病性肠病、神经疾病发现A.muciniphila丰度降低。最近的干预研究还证实如茶或富含多酚水果的饮食可增加其丰度,有助于改善糖尿病和肥胖个体的代谢功能。总的来说,来自动物和人类研究的越来越多的证据表明A.muciniphila将成为下一代有临床应用前景的益生菌。尤其是它在预防和治疗糖尿病、肥胖症及癌症,这对未来的研究具有重要意义和发展。Ol什么是AkkermansiamuciniphilaA.muciniphila是一种厌氧、革兰氏阴性、无运动、没有内生抱子的卵圆形肠道细菌,其最适生长温度是37,最适生长PH为6.5,该菌的倍增时间大
15、约是1.5hoA.muciniphila属于疣微菌门,事实上,它是人类粪便样本中发现的属于这个特殊门的唯一物种。值得注意的是,A.muciniphila具有一定的耐氧性,其暴露在空气中24h,仍然有1%以上的存活率。此外,研究还发现低氧气浓度(纳摩尔)下可以显著促进A.muciniphila的生长。A.muciniphila单独或者成对存在,很少成链生长,其代谢产物为乙酸盐、丙酸盐、1,2-丙二醇等。在提供蛋白源的基础培养基中,加入N-乙酰氨基葡萄糖、N-乙酰半乳糖胺和葡萄糖作为能源,A.muciniphila可以生长,但是在果糖和纤维二糖等其他糖类作为能源的培养基中A.muciniphila
16、不能生长,说明该菌的生长繁殖需要蛋白质。A.muciniphila的特别有趣之处在于,与大多数其他有益细菌不同,它不完全依赖于我们的饮食来喂养。即使消化道中没有营养物质,它也会以粘膜层中的粘蛋白为食。AkkermansiaMuciniphila一般通过母体获得,通常在儿童中大量存在,并随着年龄和疾病而减少。将其恢复到最佳水平可以带来许多好处。肠道中低浓度的Akkermansiamuciniphila可能表明黏液层较薄,从而导致肠道屏障功能减弱,此外还会增加细菌毒素的易位,炎症性肠病、哮喘、肥胖症和II型糖尿病患者的Akkermansiamuciniphila浓度往往较低。我们知道整个胃肠道(G
17、l)的粘膜完整性对于维持人体健康至关重要。这其中,粘液屏障的完整性是胃肠道的第一道防线。肠道黏液层的周转包括黏液的合成、分泌和降解,这是一个需要调节和平衡的微妙过程,以确保黏液保持最佳的保护功能。粘液由多种成分组成:水(90%-95%)、电解质、脂质(1%-2%)、蛋白质等。这种粘液是一种稀的、水性和粘弹性的分泌物,这要归功于被称为粘蛋白的特定粘液蛋白,它是粘液中存在的主要结构和功能成分,浓度为1%-5%。粘蛋白是一个大的、复杂的、糖基化的蛋白质家族,其特征是一个重要的元素,即“粘蛋白结构域它由一个蛋白质核心组成,该核心由含有氨基酸残基脯氨酸(Pr。)、苏氨酸(Thr)和丝氨酸(Ser)的序列
18、组成,称为富含PTS的序列,通常串联重复,其中Ser和Thr广泛为O-糖基化并赋予“瓶刷”状构象。MUC2(黏糖蛋白2)的化学结构和肠道粘液的合成domw)TRANSMEMBRANEMUaNSPaoneP&CaniPD.Gut.2020肠道菌群在肠道中的分布梯度随其位置不同而变化;微生物密度从近端到远端肠道增加,每克肠道内容物的微生物细胞数量大约如下:十二指肠中103个空肠中104个回肠中107个结肠中1012个此外,微生物密度从上皮细胞向管腔增加,在后者中发现的细菌数量最多,与管腔相比,实际上很少有细菌物种能够很好地粘附和驻留在粘液层中。除了粘附这一重要功能外,肠道微生物群对调节肠道粘液层有
19、很大贡献。需要普及一个认知就是,当我们谈到构成微生物组的各种细菌物种时,有些菌似乎比其他细菌具有更显着的影响,比如肠道基石菌,核心菌,益生菌等,确保这些个体物种的最佳水平不要太低,也不要太高可以产生对健康深远的影响。这其中包括有益细菌的关键物种之一AkkermansiaMuciniphilao谷禾肠道样本大数据库显示A.muciniphila缺乏或未检出情况在人群中很常见,尤其是那些有肠道问题的人。在健康个体中其约占肠道微生物群总数的0.5%-3%o但是也有例外,在我们在最近的检测的一个56岁女士肠道内该菌的丰度占比超50%,菌群构成如下:然而,好事太多也可能是坏事。它的名字Fuciniphi
20、la”的意思是粘液爱好者,指的是它独特的能力,降解黏蛋白和粘液层。过量的AkkermanSia将过度消耗粘液蛋白而存活下来,这是大多数其他细菌所缺乏的生存优势。在这种情况下,非粘液消耗物种的数量显着减少,导致物种多样性减少,AkkermanSia增殖异常,从而可能导致肠道屏障损伤,诱发肠道炎症、LPS进入血液的增加、自身免疫性疾病有关,神经退行性疾病等。该样本检测报告也显示菌群多样性低,肠炎和几项慢病注意风险:此外,在其它研究文献中也得出Akkermansiamuciniphila丰度高的负面研究,如:在中国人中,Amuciniphila菌的丰度与2型糖尿病呈正相关。血红素在肠道中的过度增生,
21、与A.muciniphila的粘膜溶解活性有关,在特定情况中,A.muciniphila参与促进代谢综合征。团队发现Akkermansiamuciniphila可能参与了系统性红斑狼疮的发生发展,致自身免疫亢进特征。02Akkermansiamuciniphila的基因组结构通过细菌16SrRNA测序表明其属于疣微菌门(VeiTUComiCrobia),与VeiTUCOmiCrobiUmSPinoSUm有92%序列相似性,是现在唯一已知的人类肠道疣微菌门成员。其中文译名尚无统一,在文献中以阿克曼黏细菌、艾克曼黏细菌等名字出现。为了揭示A.muciniphila的功能潜力,对其基因组进行了测序和
22、注释。发现Akkermansiamuciniphila在其相对较小的基因组中编码了大量黏蛋白降解酶,黏蛋白被其降解后其下游聚糖副产物可以交叉饲养其他肠道细菌。根据DNA-DNA杂交(DigitalDNA-DNAhybridiztion,dDDH)将23个Akkermansia属的菌株分为4种,分别为:Akkermansiasp.CAGAkkermansiasp.KLEAkkermansia.MuciniphilaAkkermansia.Glycaniphila但是发现它包含许多候选粘蛋白酶编码基因,但缺乏编码典型粘液结合域的基因。种内存在多样性。在整个基因组中发现的大量噬菌体相关序列,表明病毒
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