乙型肝炎病毒相关性原发性肝癌患者前X基因的分子流行病学意义(医学论文).docx
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1、乙型肝炎病毒相关性原发性肝癌患者前X基因的分子流行病学意义(医学论文)乙型肝炎病毒相关性原发性肝癌患者前X基因的分广流行病学意义【摘要】目的:了解前X基因在HBV相关HCC患者中的流行病学分布、前X基因和HBV基因型与HCC的临床关系.方法:患有乙肝的肝细胞肝癌患者(HCC)35例,采纳型特异性引物巢式聚合随链反应进行基因分型.同时对明确基因分型的肝癌患者,扩增前X区,TA克隆到PMD18T载体后进行单克隆测序,分析前X区在肝癌患者的表达状况,对前X区和基因型及相关病情进行探讨.结果:HCC患者35例中B基因型1例,C基因型24例,B/C混合基因型8例,未定型者2例.明确基因型的患者33例,进
2、一步扩增前X区,并经TA克隆获得93个单克隆株中,经测序表明,有65个单克隆株编码前X多肽,占69.9%.HCC患者33例中有29例编码前X多肽,编码率为87.9%,高于慢性乙型肝炎患者58.8%的编码率.C基因型前X多肽编码率为91.6乐B/C混合型编码率为87.5%(Pgt;0.05),B基因型无编码.前X区的表达与年龄,性别,家族史,AFP,HBVDNA,A1.T水平间无关(Pgt;0.05).结论:HCC患者中C基因型、B/C混合基因型较为多见.前X多肽在HCC患者中有较高的编码率,前X区多肽可能和HeC之间有确定相关性.【关键词】肝炎病毒乙型基因型前X基因癌肝细胞O引言乙型肝炎病毒(
3、hepatitisBvirus,HBV)在其负链上含4个部分重登的开放读码框架(OPenreadingframe,ORF)即前S/S区、前C/C区、P区和X区,分别编码7种性质不同的蛋臼如HBcAg,HBcAg,HBsAg等.有探讨表明,X区编码的HBxAg与肝细胞肝癌(HCe)的形成亲密相关1.探讨证明,在XORF的上游还存在一个新的ORF即前XORF2,而关于其的功能探讨尚不多见,是否具有类似功能尚不确定,我们对前XORF功能进行初步探讨.1对象和方法1.1.对象200401/200412HBVDNA阳性的HCC患者35例.全部患者均经B超、CT和核磁共振(VRD或血管造影等临床诊断为乙肝
4、相关性肝癌,采纳蛋白筋K、酚氯仿异戊醇法提取血清HBVDNA.乙肝标记物(HBVM:HBsAg,AntiHBs,HBeg,AntiHBe,AntiHBc)的测定均采纳E1.ISA法检测,试剂由华美生物工程有限公司供应.生化指标(A1.T)由我院全F1.动生化检测仪常规测定.1.2方法通过比对不同HBV基因型序列以及参考Natio3等设计的6种主要基因型的分析方法,设计了共同的外引物P1.,P2,进行PCR扩增,并以扩增产物为模板进行基因型特异性内引物扩增.基因型特异性内引物扩增分为A,B两组,其中组包括共有的上游引物P3,PA(基因型A特异性下游引物),PB(基因型B特异性下游引物),PC(基
5、因型C特异性下游引物),B组包括上游引物P4以及基因型D,E,F的特异性下游引物PD,PE,PF,同时行PCR扩增.取第2轮PCR扩增产物51.经过20g/1.琼脂糖凝胶电泳后推断HBV基因型,依据电泳结果推断HBV基因型.以35例HCC患者中明确HBV基因分型的33例患者HBVDNA溶液为模板,依据前X上游引物Px1.,下游引物为Px2,扩增前X区4.Px1.下游第3133nt处为前X区起始密码子TG,Px2上游3032nt处为X区起始密码子ATG,犷增的靶区域全长231nt,其中前X区全长为168nt,将PCR产物回收并连接至PMD18T载体,将连接好的重组体转入感受态细胞,经宓卡青霉素(
6、AmP)和Xga1.蓝白斑法初步筛选阳性菌落,进一步提取质粒采纳PCR法鉴定.对经过鉴定的胜利导入前X基因的菌落送测序.统计学处理:全部数据应用SPSS13.0统计软件分析,不同组间率的比较采纳2检验,均数比较采纳t检验.P1.tiO.05表示有统计学意义.2结果2.IHBV基因型应用该基因型分型方法,A组PCR产物电泳时A基因型为68bp,B基因型为281bp,C基因型为122bp(图1)刀组电泳时D基因型为119bp,E基因型为167bp,F基因型为67bp.本组的35例患者中,B基因型1例,C基因型24例,B/C混合基因型8例,未定型者2例,未见其他基因型.2.2前X基因PCR扩增扩增的
7、靶区域全长231bp,胜利构建出PMD18T前X载体后,以PMD18T载体上游引物M13和Px1.为上游引物、Px2为共有的下游引物同时行PCR扩增,可得到308bp和231bp的片断,说明克隆胜利.2.3前X基因序列分析经鉴定胜利导入重组体的菌落,随机共选取93株送测序.前XORF全长168bp,位于测序片断的第31位至第198位,依据其测序结果推定核甘酸序列如下:ATGGGGCTTGGcTATTGGccATcGCCGCATGCGTGGAACCTnGTGGCTCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACTCCTAGCAGCTTGTTTTGCTCGCAGCCGGTCTGGAGCGAAAC
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