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1、系统生物学:我们了解它多少呢?,提纲,系统生物学是新出现的吗 系统生物学是否重要 什么是系统生物学 我们对系统生物学了解多少呢 系统生物学是否有用,文章的主要思想,大部分的生物功能是由大分子间的相互作用引起的。系统生物学的主要目的在于以定量、可预测的方法来理解复杂的细胞通路和胞间的交流的规则,从而揭示复杂的生物功能(例如代谢、细胞信号传递、细胞周期、细胞凋亡、分化以及转化)。系统生物学似乎适合于研究复杂的多因素疾病。,文章的主要思想,系统生物学是丰富的,广泛的以及多样化的,并不是模糊的。这本书从头至尾用来定义这种丰富并多样化的系统生物学,也就是说,让系统生物学家们自己来定义它。,系统生物学是新
2、出现的吗,人们的普遍认识:不知道什么是系统生物学 系统生物学“只不过是对现有的科学的新接触”系统生物学“毫无疑问应该是陈旧的生理学”系统生物学是“要求给予额外资金的分子生物学”“系统生物学是由工程师解释生物是如何作用的”,系统生物学是新出现的吗,系统生物学使用了物理、化学、分子生物学和数学方面的知识。系统生物学发展于这些科学和其他科学的整合,这是相对较新的;系统生物学旨在寻求通过动态的相互作用产生活细胞功能性质的机制。系统生物学并不只是如生理学那样观察并描述生命系统的功能。系统生物学还添加生物化学和物理学的机械方面的兴趣在生理学里,当然系统生物学还具有数学分析工具。事实上,系统生物学是一门科学
3、,因为它旨在寻求普遍原理而非特殊例子。为了去发现那些原理,系统生物学使用任何可用的科学或技术。,系统生物学是新出现的吗,因此,系统生物学新旧同时存在:以新的关注焦点结合以前的学科,系统生物学将自己与其他科学区分了开来。,。,系统生物学是否重要,遗传密码的破解 大量测量遗传密码表达的新技术的兴起 精确的知道组成生命有机体的成分 什么是生命?,系统生物学是否重要,随着关于功能基因组学数据的科学文献如洪水一般的发表,它的读者越来越多的面临一个矛盾:任何人可以“知道”不了解的一切。随着关于p53的每一篇新发表的论文,我们对p53的理解似乎更少了,而不是更加理解生物是如何作用的,那么问题出在哪里呢?,人
4、类智力和理解能力的限制!,系统生物学是否重要,系统生物学的对于人类的智力而言可能过于复杂,除非人类被某种信息技术所辅助。许多疾病是多因素疾病和强非线性的,即一个因素的效应被另一因素的强度所决定。新的科学模式所需要的正是系统生物学。因此系统生物学或许和之前的相对论和量子力学一样伟大。,什么是系统生物学,定义的重要性:帮助人们识别一个崭新的科学领域;指导研究工作沿着正确的方向,而不是以一个新的名称在同样的问题上下功夫。如何定义:通过实例,即通过挑战系统生物学家来解释自己所认为的什么是系统生物学;强调这个定义是多样化和变化的,而不是模糊的。,什么是系统生物学,作者给出的定义:从大分子间的相互作用来探
5、寻生命有机体功能性质的产生的背后的原理的科学 要求其他人挑战这个定义并通过范例的形式添加自己的发现。,我们对系统生物学了解多少呢?,应该从时间,空间,化学和发展过程方面来理解功能属性是如何通过这些分子的众多的非线性的相互作用来产生并维持的,并且,应该以完备的相关实验来完成这一点,即通过测定分子和分子间的相互作用。区别于生理学和分子生物学,它是分子生物学和生理学的非线性的综合体。,系统生物学是否有用,系统生物学已经起作用的部分:有人已经发现了一种在细胞周期中控制细胞大小的新机制,这种机制至少能够用实验的方法来验证。细胞周期变化的定量测量。发现了新的靶向药物。,总之,让我们把系统生物学作为对科学和技术的挑战,即系统生物学“大挑战”,这将有助于我们了解人类健康,疾病和治疗的分子基础。通过更好地定义我们需要关注的内容,这本书可以帮助组织这个大挑战。,
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