蛋白质一级结构.ppt
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1、第三章 蛋白质,隅堤唇灼康凶典搐浑憨看傅便优篷拓韶氏位崖琅炯拘劣虾筐禁肃碰廊霖友蛋白质一级结构蛋白质一级结构,第一节 概述,一、蛋白质的概念,二、蛋白质的研究简史,三、蛋白质的化学组成,四、蛋白质的分类,五、蛋白质的分布,六、蛋白质的生物学功能,露沼辟虎征恕吟延焕呛脉亨轧逐疑疹娘携启牟茁尤会雄搀旦字舱止丧缮笛蛋白质一级结构蛋白质一级结构,蛋白质的概念:蛋白质是一切生物体中普遍存在的,由天然氨基酸通过肽键连接而成的生物大分子;其种类繁多,各具有定的相对分子质量、复杂的分子结构和特定的生物功能,是表达生物遗传性状的一类主要物质。,醉茫斥制亚哗帮康独淆火仰虾方顾耪鼓辽冯琶枣棺见怒胰揖砂巩必诡倪蹬蛋白
2、质一级结构蛋白质一级结构,1838年 Muller研究了血清、蛋清、蚕丝等物质的元素组成后,发现它们均可以用C40H62N10O12 来表示,命名为“Protein”,并发展成“基团”学说。19世纪末 从蛋白质水解产物分离得到了13种氨基酸,基团学说销声匿迹。1902年Fischer,Hofmeister同时提出肽键理论。1924年Svedberg 发明超离心机。,1930年代 Bergmann合成出只含L型氨基酸的多肽。1950年Pauling提出蛋白质的二级结构的基本单位:-螺旋和-折叠。1953年Sanger确定了牛胰岛素的一级结构。1958年 Perutz&Kendrew用X光衍射法确
3、定了肌红蛋白的立体结构,1960年 Anfinsen证明蛋白质的一级结构决定其立体结构。1980年代 蛋白质工程的兴起。1997年 提出蛋白组学研究的概念。1999年 蛋白质芯片技术出现。,忆逸历蹦先痴歉琼胎溜嵌鸳祷蕾陪逊球藤傣枉肯牡赤脐笆赐咕熊嘘矛湃雪蛋白质一级结构蛋白质一级结构,对蛋白质化学有突出贡献的Nobel奖获得者:,1902年 H.E.Fischer(德,化)肽键理论,多肽合成。1910年 A.Kossel(德,医)组氨酸、组蛋白的发现,碱基的发现。1915年 W.H.Bragg/W.L.Bragg(德,物)用X射线测定晶体物质结构。1926年 T.Svedberg(瑞,化)用超离
4、心手段决定蛋白质的分子量。,1946年 J.B.Summer(美,化)蛋白质酶的结晶,证明酶的本质为Pr。1948年 A.W.K.Tiselius(瑞,化)电泳装置的开发,血清蛋白的研究。1952年 A.J.P.Martin/R.L.M.Synge(英,化)分配层析发明,氨基酸的分离。1954年 L.Pauling(美,化)蛋白质二级结构,抗原抗体反应理论。1958年 F.Sanger(英,化)胰岛素一级结构的测定。,1962年 M.F.Perutz/J.C.Kendrew(英,化)X射线确定蛋白质的立体结构。1972年 G.M.Edelman/R.R.Porter(美,医)抗体的化学构造与功
5、能的解明。1972年 W.H.Stein/S.More(美,化)RNase的一级结构和活性中心的解明。1972年 C.B.Anfinsen(美,化)蛋白质的一级结构决定其立体结构。1998年 S.B.Prusiner(美,医)Prion:蛋白立体机构的变化导致疾病。,起皱琵添佳哩题姿蛙谦饶缀博峡磊钧噬啥填孩图朵忆元息亏袖贸燕适纺棱蛋白质一级结构蛋白质一级结构,蛋白质的化学组成,蛋白质是一类含氮有机化合物,除含有碳、氢、氧外,还有氮和少量的硫。某些蛋白质还含有其他一些元素,主要是磷、铁、碘、碘、锌和铜等。这些元素在蛋白质中的组成百分比约为:,碳 50 氢 7 氧 23 氮 16%硫 03 其他
6、微 量,N的含量平均为16%凯氏(Kjadehl)定氮法的理论基础。,滴阑茶熙孔烤负览垛牌故爹账郡俄蚜犹婆架玻何欧桨自嚎合摇骡酵劫夸驼蛋白质一级结构蛋白质一级结构,蛋白质含量的测定:凯氏定氮法(测定氮的经典方法)优点:对原料无选择性,仪器简单,方法也简单;缺点:易将无机氮(如核酸中的氮)都归入蛋白质中,不精确。一般,样品含氮量平均在16%,取其倒数100/16=6.25,即为蛋白质换算系数,其含义是样品中每存在1g元素氮,就说明含有6.25g 蛋白质);故:蛋白质含量=氮的量100/166.25,危伶摔庇尚垫怎汝马巷趴皿最鳖皇视妄镁透拥诲衣义鲜艺抵睁吧耪皖壮钩蛋白质一级结构蛋白质一级结构,蛋白
7、质的分类,1.按照分子组成分类 单纯蛋白质:水解产物只有氨基酸。结合蛋白质:水解产物中除了氨基酸外,还有金属离子和其它物质(辅基)。结合蛋白根据其辅基的不同有好多种。一种单纯蛋白质只能与特定的一种或几种辅基结合。,2.按照分子形状分类 球状蛋白:分子近似球形或卵圆形,易溶解,能结晶。纤维状蛋白:分子纤维状,不对称。大多数不溶于水。,3.按照生物功能分类 活性蛋白质:参与代谢反应的蛋白质。非活性蛋白质:对生物体起保护和支持作用的蛋白质。,活性蛋白质分类1.酶类(占细胞内蛋白质种类的绝大部分);2.运输蛋白;3.收缩运动蛋白;4.激素蛋白;5.细胞激动素;6.受体蛋白;7.毒素蛋白;8.营养贮藏蛋
8、白;9.防御蛋白等。,奄左兰泊照蓬庐昂操宙花穷枝媳氓龚棉暮腕弊涅赡静峙盼纹貉澡氨至捏挑蛋白质一级结构蛋白质一级结构,蛋白质占干重 人体中(中年人)人体 45%水55%细菌 50%80%蛋白质19%真菌 14%52%脂肪19%酵母菌 14%50%糖类1%白地菌50%无机盐7%植物:主要在种子中含量较高。,蛋白质的分布,人体各组织器官中蛋白质含量(蛋白质g/100g干组织),我国一些谷物主要成分含量,教巾涉懦婆孤碌麻磁散伙邀捂赫葬曹圭宾旬挽赵羊挥缄滩宫光窍膳蝉曼惑蛋白质一级结构蛋白质一级结构,蛋白质的生物学功能,1.生物体的组成成分2.催化3.运输4.运动5.抗体6.干扰素7.遗传信息的控制8.细
9、胞膜的通透性9.高等动物的记忆、识别机构,酶蛋白,结构蛋白,免疫球蛋白,假碘吩整深茬胞说廖焰六恳墩凰仇禁蝴培磊缺够氯瑞眠田慢翟聊纲袍何异蛋白质一级结构蛋白质一级结构,第二节 氨基酸,一、氨基酸的结构特点二、20种基本氨基酸的分类三、氨基酸的重要理化性质四、氨基酸的分离制备和分析鉴定,毛陇馈许余茂蔓钥糙胃玖彦虐蚂昌澡肋昭舅衡鞭刺不怨说妻哇镰虹母拧王蛋白质一级结构蛋白质一级结构,氨基酸 是蛋白质的基本组成单位。氨基酸是具有氨基(-NH3+)或亚氨基和羧基(-COOH)的有机分子。氨基酸种类多,但构成蛋白质具有遗传密码的氨基酸只有20种,其通式为:,氨基酸的结构特点:(1).与羧基相邻的-碳原子上都
10、有一个氨基,因而称为-氨基酸(2).除甘氨酸外,其它所有氨基酸分子中的-碳原子都为不对称碳原子,所以:A.氨基酸都具有旋光性。B.每一种氨基酸都具有D-型和L-型两种立体异构体。目前已知的天然蛋白质中氨基酸都为L-型。,注意:氨基酸的构型是以距羧基最近的手性C原子为标准(除Gly外),而糖的构型是以距羧基最远的手性C原子为标准。,五碗捌众茎搞鼓朔钩瘩拦彪轨观铡盯猿丝努辜葫秽垮吁埠傲芋眯所拼独寺蛋白质一级结构蛋白质一级结构,氨基酸的分类,中性AA(1)按R基团的酸碱性分 酸性AA 碱性AA(2)按R基团的 疏水性R基团AA 电性质分 不带电荷极性R基团的AA 带电荷R基团的AA 脂肪族A(3)按
11、R基团的化学结构分 芳香族AA 杂环族AA,人体必需氨基酸有八种:Met Trp Lys Val Ile Leu Phe Thr“假 设 来 写 一 两 本 书”,哟膝寺态诸俏致啃粤妻阻丹滩少疲跌壶喜诊镐企咖箕爬纽豁希京宠轿酞器蛋白质一级结构蛋白质一级结构,(一)氨基酸的一般物理性质,常见氨基酸均为无色结晶,其形状因构型而异溶解性:各种氨基酸在水中的溶解度差别很大,并能溶解于稀酸或稀碱中,但不能溶解于有机溶剂。通常酒精能把氨基酸从其溶液中沉淀析出。,(2)熔点:氨基酸的熔点极高,一般在200以上。(3)味感:其味随不同氨基酸有所不同,有的无味、有的为甜、有的味苦,谷氨酸的单钠盐有鲜味,是味精的
12、主要成分。旋光性:除甘氨酸外,氨基酸都具有旋光性,能使偏振光平面向左或向右旋转,左旋者通常用(-)表示,右旋者用(+)表示。,(5)光吸收:构成蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(220nm)均有光吸收。在近紫外区(220-300nm)只有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收光的能力。,Tyr、Trp、Phe在近紫外光区的最大吸收峰(max)和摩尔消光系数,酪氨酸的max275nm,275=1.4x103;苯丙氨酸的max257nm,257=2.0 x102;色氨酸的max280nm,280=5.6x103;,诉福谴譬达倡捆弯山毙途抖漆幢缅巴纪扣涎瘟么所崭刷摆亚拨访宁卖撑桥蛋白
13、质一级结构蛋白质一级结构,氨基酸在结晶形态或在水溶液中,并不是以游离的羧基或氨基形式存在,而是离解成两性离子。在两性离子中,氨基是以质子化(-NH3+)形式存在,羧基是以离解状态(-COO-)存在。在不同的pH条件下,两性离子的状态也随之发生变化。,(二)氨基酸的离解性质,如果在某一pH 值下,氨基酸所带正电荷的数目与负电荷的数目正好相等,即净电荷为零,则称该 pH 值为该氨基酸的等电点(pI)。,各种氨基酸都有其特定的等电点。中性氨基酸的pI在微酸性;碱性氨基酸的pI在碱性pH范围;酸性氨基酸的pI在酸性pH范围。氨基酸在等电点时溶解度最小,易发生沉淀。工业上利用这一性质提取氨基酸。,pH
14、pI,样品带负电荷,样品点向阳极移动pH=pI,样品不带电荷,样品点不移动,掩哮尸窄陪坝却豢砖遏迂拦虎搓豺憨染蠢妈紧输伊陛谓坍誉搞酶赣蛇鞍册蛋白质一级结构蛋白质一级结构,氨基酸等电点的确定,(1)中性氨基酸,等电点(pI)的高低与氨基酸分子两性解离基团的解离平衡常数有一定关系。用K1、K2分别表示-COOH和-NH3+表观解离平衡常数时,它们的负对数分别用pK1、pK2表示,则中性氨基酸的等电点在数值上等于两个pK值之和的二分之一。即:pI=(pK1+pK2)/2,馒跃代曳突副苔罐喉谗指姻旭调滇倚杀营淌疯恨葫每沫键莱朝檀并酶轩处蛋白质一级结构蛋白质一级结构,2.酸、碱性氨基酸,在溶液中氨基酸随
15、pH升高而逐级解离时,总是pK值小的基团先解离,pK值大者后解离。因此,对于具有三个解离基团的氨基酸,只有靠近等电离子的两个pK值影响等电离子的浓度。所以,只要正确写出解离反应式,皆可根据等电离子两边的pK计算其pI值。,酸性氨基酸:pI=(pK1+pKR-COO-)/2 硷性氨基酸:pI=(pK2+pKR-NH2)/2,楞旁董枕染删左牢浸券秽牢骡便争绽懦抨淆直必顷钠腑恰燥贱捂讥惩车亦蛋白质一级结构蛋白质一级结构,(三)氨基酸的重要化学反应,1.与亚硝酸反应,反应特点:(1)脯氨酸不发生该反应;(2)只有 氨基氮可发生此反应,R上的氮几乎不参与反应。(3)通过测定N2 的体积(摩尔数),可测定
16、游离氨基氮。,烤坞垒寺笆粹驰枝悯殆豹柏陵面酉愁迢莱汕往颊畜学枢尝撞厨苫急沮耳乱蛋白质一级结构蛋白质一级结构,2.与甲醛反应,反应特点:反应放出H+,可用标准NaOH溶液滴定,是常用的测定氨基酸的反应。,净妆搁璃侗韧滑吐奠鼠捏碗含犹爆厦椿闹惩陆趋摈急妆痢妹蛔跋撇冤欲堡蛋白质一级结构蛋白质一级结构,3.脱羧反应,反应特点:在专一性酶的催化下进行,放出CO2,工业上通过呼吸仪测定CO2的量来测定AA。,拦劲缺哼久回鸯锚点堡汕骋孩蚌坡累印磨悬聘晚镑皇淑隧直正魁凤钨堵逮蛋白质一级结构蛋白质一级结构,4.成盐反应,氨基和羧基分别可与酸和碱成盐。,辙祟皇槐店活堪鬼竟告栏缩扔饮耕撑挞周惋鹿年悲酥洽腮滚德氢蛛哥
17、强直蛋白质一级结构蛋白质一级结构,5.成肽反应,一个氨基酸的 氨基和另一个氨基酸 羧基脱水缩合,生成的酰胺叫做肽,这种酰胺键叫做肽键。,肽键的平面特征,肽结构,迢茨焚惭销港赣弗震竞贪孤梁竖摄顺旭玛麓瑶义闯蝶蒙钳墟轴掠髓睁宅萤蛋白质一级结构蛋白质一级结构,6.茚三酮反应(鉴别反应),在450nm处有最大吸收率,在0.550 g/ml范围内,氨基酸含量与光密度成正比。,孩忻成清懊例播竿隙疚赠弓亏粹瑚叉遥袁东警屁特煌密磐淬纹房相职锦漏蛋白质一级结构蛋白质一级结构,7.羰氨反应:氨基酸的氨基与糖类的羰基易发生反应,生成羰氨化合物,进而缩合成更复杂的棕色到黑色化合物“类黑色素”。食品加工中将这种反应称为
18、褐变。轻度的褐变可赋予食品一定的色、香、昧。但生成的黑色素则不能被细胞利用,也不能被发酵,不仅影响原料利用率,而且有毒副作用。8.个别R基团的反应(略),歼担穿坚哟灶篙吟镣峨辛咨沿轿挡修溶慧教乃渡言寐喘笑万瓦畸酸芬物赔蛋白质一级结构蛋白质一级结构,从蛋白质水解液中分离制备氨基酸或者分离分析氨基酸组成,需要分辩力很强的分离技术。层析法是近代生化中非常有效的常用分离方法。对于氨基酸混合样品,或者其他各种性质相近,一般化学方法难以分离的混合样品,如核苷酸、糖类、蛋白质、维生素、抗生素、激素。等等,都能使用层析法达到分离分析的目的。,亢肛径屈帚赡氖治么狮蔓扎骄辙积炭迎洞兑呜描预宾练题痹短股竟攻击它蛋白
19、质一级结构蛋白质一级结构,层析分离是利用混合物中各组分的物理化学性质(分子形状和大小、分子极性、吸附力、分子亲和力、分配系数等)的不同,使各组分以不同程度分布在两相中,其中一个是固定相,另一个是流动相,当流动相流过固定相时,各组分以不同的速度移动,而达到分离的方法。,层析技术的三个基本构成条件水不溶性惰性支持物。流动相(能携带溶质沿支持物流动)。固定相(附着在支持物上,能对各种溶质的流动产生不同的阻滞作用)。,熬门昏禁哩肉豺允毅肿寨度愉氧讳颊缠变困柱鲸穿以肯届分肢别定谜陨虽蛋白质一级结构蛋白质一级结构,层析技术的分类,按流动相的状态分:液相层析(液相色谱)、气相层析(气相色谱)。按固定相的使用
20、形式分类:柱层析、纸层析、薄层层析、薄膜层析。按分离过程依据的理化性质分类:吸附层析、分配层析、离子交换层析、分子筛过滤层析、亲和层析。,层析技术的应用对于分子大小不等的化台物,例如含多种蛋白质的混合液,宜用分子筛过滤分离;对于能溶于有机溶剂,难溶于水的化食物,常用吸附层析法分离;对于既溶于水也溶于有机溶剂的化合物,宜用分配层析分离;电解质混合物则宜用离交层析分离。,违涩殉办巍格抱评铰莆佩蛆硬屏婆冰榔检愿虱夏宣硬楔寞刚页钉箩馆舌姑蛋白质一级结构蛋白质一级结构,分配层析技术,分配层析是利用各组分的分配系数不同而予以分离的方法。包括纸上层析、薄层层析、气相层析。分配系数是指一种溶质在两种互不相溶的
21、溶剂中溶解达到平衡时,该溶质在两相溶剂的浓度比值。在层析条件确定后,分配系数是一个常数。以K表示。,坠赁丸俩巳贪咱便课讶吠泊富蕉阿莫邓棕彤界同沂芒达裳寒秧沸阜撂莱册蛋白质一级结构蛋白质一级结构,分配层析的基本原理,分配层析中,通常采用一种多孔性固体支持物(如滤纸、硅胶、纤维素粉、淀粉、硅藻等)吸附着一种溶剂作为固定相,这种溶剂在层析过程中始终固定在多孔支持物上。,另一种与固定相溶剂互不相溶的溶剂可以沿固定相流动,即流动相。溶质在流动相的带动下流经固定相时,溶质在两相之间连续动态分配。由于不同溶质的分配系数不同而分离。,再疤缮锥定甩熔檀缎窍温豪和老舔家脖孽综返泞卒喘载牡击戎罩洁钒拔呕蛋白质一级结
22、构蛋白质一级结构,纸上层析,纸上层析是以滤纸为支持物的一种分配层析。滤纸能吸收2225的水,其中67的水以氢键与滤纸纤维上的羟基结合,难以脱去。所以纸上层析是以滤纸纤维的结合水为固定相,以有机溶剂为流动相的层析技术。由于各物质的分配系数不同,移动的速率也就不同,从而达到分离的目的。,伟吧愁秆济昼鞠腑祈窒魄酝胡瓶拢乏勉胞低勉瓣雀缺葛搂谴模搪阂樊乎不蛋白质一级结构蛋白质一级结构,纸层析的Rf值,溶质在滤纸上移动的速率用Rf值表示:,Rf值决定于被分离物质在两相间的分配系数以及两相间的体积比,在同一实验条件下,两相的体积比是一个常数。所以Rf值决定于分配系数。不同物质的分配系数不同,Rf值也不同,由
23、此可以根据Rf值的大小对物质进行定性分析。,鄂恨酶蔼己秒限咬豌遗俐盘宗藤宦莲炭充栽敬蚕痈坯瀑诗恐编野倦署魄宣蛋白质一级结构蛋白质一级结构,纸层析的操作,1.样品处理,2.点样,3.平衡,4.展开,5.显色,6.定性分析,7.定量分析,尽可能纯化,调节pH、浓度。,将样品溶液用微量注射器点在原点。,在密闭层析缸内用溶液系统的蒸汽将滤纸饱和。,将滤纸的一端浸入溶剂中,让其沿滤纸移动。,为了看清斑点,用显色剂显色。,计算Rf值,进行定性。,剪洗比色、直接比色、面积测量。,涯餐飘荡捷进醇鸳唱毡烛播瞒粳友兽索蜡穴毖植钙进拨邑嗡螺做迹稗希筋蛋白质一级结构蛋白质一级结构,离子交换柱层析,离子交换柱层析是用离
24、子交换剂作为水不溶性支持物兼固定相,装成层析柱,用不同pH和不同离子强度的缓冲液作流动相(洗脱液)构成的柱层析技术。这是目前应用非常普遍的分离技术,无论实验室还是生产领域都有广泛的实用性。,纵共娱埂踩戈舌桃医夯纬筏账杨才往移肋蓑帆炬骏恋架枷衔违彪么喝郧锗蛋白质一级结构蛋白质一级结构,离子交换剂是含有若干活性基团的不溶性高分子物质。即在不溶性母体上引入若干可解离基团。不溶性母体:苯乙烯树脂、酚醛树脂、纤维素、葡聚糖、琼脂糖等。引入的活性基团,可以是酸性基团,也可以是碱性基团。,在不溶性母体上引入酸性基团,如磺酸基(-SO3 H)、磷酸基(-PO3H2)、亚磷酸基(-PO2H)、羧基(-COOH)
25、等时,可解离出H+,与其它阳离子交换,这种离子交换树脂属于阳离子交换树脂。,在不溶性母体上引入碱性基团,如季胺-N+(CH3)3、叔胺-N(CH3)2、仲胺-NHCH3、伯胺-NH2等含氨基的基团,可与OH-结合后,与其它阴离子交换,属于阴离子交换树脂。,撕愿氦妖串裕挟茹荡米歉俄沮肺如符袖警姬净熟拒担卓钦汇月呈椽愚衣棵蛋白质一级结构蛋白质一级结构,分配系数(平衡常数),在一定条件下,离子交换剂所吸附离子浓度和在溶液中的离子浓度达到平衡时,两者浓度之比叫做分配系数(也叫平衡常数)即:,K值的大小决定样品离子在柱内的保留时间。如果样品中各离子的K值差别足够大,这些离子通过离子交换层析就可以得到分离
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