蛋白质体核心实验室.ppt

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1、蛋白質體核心實驗室Proteomics Research Core Labortory,兴猜菠淫嗜涟蔡阿帮搬菱显吨擦陶禾狙钉吭科暴绒挂砸儡邦怖垃室赶忠俯蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗室簡史,本校蛋白質核心中心於李英雄研發長的領導下建構於2006年12月，李英雄研發長指出蛋白質體的研究是為了在醫學研究上跟得上時代，這也是一項跨時代的突破，因為蛋白質體研究層級是奈米層級的研究，了解蛋白質比了解基因更重要，所有疾病的發生都是導因於蛋白質的作用，了解蛋白質才能了解整個基因的結構，未來可應用於預防醫學。蛋白質體學啟動計畫分為三期同時或依序進行，每一期都有明確達成的目標，第一期是先導期，目標為

2、執行一百個蛋白質體學相關的研究計畫，即所謂百蛋計畫，這項計畫的兩大終極目標就是要增進醫學先知及拓展臨床應用,饵性畸人鳞衫钞卉稍诈派浚触框仅裂有煤堂故罢克帅毖怪焉黔佩情粮氰匆蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗室組織圖,李英雄 研發長,韓至強 副研究員,劉玉晴 助理研究員,廖欣儀 助理研究員,廖彣欣 研究助理,番仑盛曰枷除冰饯榜申猖甄骤塌札腋买褐仁掖收穿舱宿燎瑰纯鲁封甚禁究蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗室遠景,近程:促進中國醫藥大學和院區各種有關蛋白質體分析的研究合作。中程:透過生物醫學上蛋白質體分析於多方面的癌症研究，達到提升中國醫藥大學和醫院的研究及研究技能。長程:利用新穎

3、的蛋白質體分析技能，創造出新的生物資訊與研究領域。,深疟髓雷灼葱语唐长男苇惮捆亏宣逾冯露毙诌宗外跟剂岸屑榴菩饲宪肯危蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗室空間規劃,Bench,Bench,Bench,-80冰箱,-20冰箱,4 冰箱,4 冰箱,藥品櫃,廖欣儀,專任研究助理,助理研究員,助理研究員,副研究員,水 槽,廖彣欣,劉玉晴,韓至強,倒立 顯微鏡,正立 顯微鏡,PC,PC,Ultraflex TOF/TOF,MASCOT資料庫,PC,LC-Mass,LC 樣品盤收集系統,Robot,Robot,Robot,PC,PC,湃缉客局仇墨渴运停灾地豪国袍屠恍鱼蛾傻忠腋肛教锤每勇瞥愈饵疑甄焰蛋

4、白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗設備儀器,ultraflex III&ultraflex III TOF/TOFUltimate Performance MALDI-TOF&TOF/TOF Systems,smartbeam laser technology combines Nd:YAG laser characteristics with nitrogen laser performance,a must for MALDI Imaging High mass resolution across a broad mass range,delivered by the proprie

5、tary panoramic PAN technology.Optimum result without tuning or changing parameters Unique T3-sequencing capabilities,allowing top-down sequence analysis on many intact proteins with ease High-throughput analysis and sensitive detection of labile protein modifications delivered by tunable laser speed

6、 from 1-200Hz,脾贯画醒才迢窟族鸭灯柳锗殉冗居谦客翱谷致拿徊命切砖禽仁卉吃药漠兑蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗設備儀器,HCTultraThe ultra Performance High Capacity Trap,protein identificationprotein characterizationde novo peptide sequencingdifferential proteomicsmetabolite profiling,腺孽舌徘介莹社否全撕怔铭放灌乞涯歌眶锣医撇拣拼卓尽虑卖邱丛谈榴阉蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗設備儀器,PROTE

7、INEER dpDigest&Prep Workstation,PROTEINEER dp is an integrated workstation for gel spot digestion and processing including MALDI preparation,and thus automates the PROTEINEER workflow from 2D gel separation to mass spectrometric identification and characterization,昭殷窘岿号替奢奎旷颊廊跃兑削仲裔津豫将抓纫锭恶固舵乙偶惭钦田耐宗蛋白质

8、体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗設備儀器,PROTEINEER spIIAutomated Spot Picker,The PROTEINEER spII Spot Picker enables automated 2D gel imaging,spot detection and selection from 2D gels into 96 micro well plates.As part of the PROTEINEER system,the sp automates the Proteomics workflow from 2D gel separation to mass sp

9、ectrometric identification and characterization.,模黎土苫怨阵厚稻伎蔚土顶信玛慨女判飘撂添醋群讲烘狼某惕员勇樟玉雨蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗設備儀器,ClinProtRobot,The ClinProtRobot automatically carries out all necessary preparation steps of the samples including the final spotting on the MALDI target,ready for MS analysis.All pipetting ste

10、ps are performed by the robot without the necessity of user intervention thus providing highly reproducible mass spectra.,挽界弧茵蛆窗腕誊典峻攘陵饶邯哪崭祟旁倚燎裴情舒窿删赴敏杜驹调丸嫉蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,等電位點聚焦儀(Iso-electric Focussing；IEF):根據蛋白質等電點的不同進行分離，如:IPGphor(Amersham Biosciences)。二維電泳:依據蛋白質分子量的不同進行分離(如:HOEFER SE600 Ruby)。圖

11、像分析:Coomassie、銀染或螢光染色等各種膠體的影像分析。PROTEINEER spII_Automated Spot Picker:膠體上的點以自動化機械手臂將點擷取。PROTEINEER dp_Digest&Prep Workstation:擷取後的點以自動化機械手臂進行in gel digestion。ClinProtRobot：尋找biomarker的自動化機械手臂。飛行式質譜儀(MALDI-TOF/TOF)：ultraflex III TOF/TOF液相層析質譜儀(LC-MS):ESI-Ion Trap MS(n)_HCTultra Nano 2-D HPLC System w

12、ith MALDI micro-Fraction Collector:PROTEINEER fc_LC-MALDI Fraction Collector資料庫(Data base):MASCOT(Intranet version of the internet search software from Matrix Science),實驗設備儀器,榜脉蒋诬蝴六娃打蘸脸堕戊石肪疽赎灸戊灰饰抛友恋射阑资棘卜侈贡资荤蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗室編制狀況,主持人：李英雄 研發長成員：韓至強、劉玉晴、廖欣儀、廖彣欣共計：5人,贿敲泳侨塞首腋臼乃莹懦路家疼幌抹籍戈珊勋苏衣峦绢混室浅釜妨猜屈

13、但蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗室主持人簡介,李英雄研發長於1969 年台大醫科畢業後於住院醫師期間開始涉獵心臟學。並在英國Midhurst Medical Research Institute 進修基礎心臟學研究。1976 年晉升為台灣大學醫學院講師及附屬醫院內科主治醫師。1977 年起李研發長到長庚紀念醫院擔任心臟血管內科系主任，並為長庚大學校院體系研發會主席。李研發長歷任長庚大學臨床醫學研究所所長、長庚紀念醫院副院長、長庚大學醫學院院長，並擔任中華人民共和國中國科學院客座研究員，北京大學、北京醫科大學、上海醫科大學、中國醫科大學、揚州大學、成都中醫藥大學及福建醫科大學客座教授

14、，學術研究橫跨海峽兩岸。李英雄研發長在臨床醫療工作領域上專精心臟導管術、冠狀動脈攝影術及臨床心電生理檢查。他是世界上首創以電極導管經主動脈到左心室紀錄His bundle electrogram 者。此外李英雄研發長也是中華民國電子顯微鏡學會的創會理事長，並曾連任理事長達10 餘年，現為該學會的榮譽理事長；而蛋白質核心中心在李英雄研發長的領導下建構於2006年12月，應運有關蛋白質體之研究是未來醫學研究之趨勢，希望結合學校與附設醫院相關之研究資源，提出100 個與蛋白質體有關之研究計畫。,主持人(實驗室負責人)資歷：,伦诲敝细汝魁将物鄂纪腰毛宅墙肝匿犁郁杠襄捌造械唯堑封蔬煌嘲霄滋碑蛋白质体核心

15、实验室蛋白质体核心实验室,研究主題,CMU95-149 基因受損時，RPH1與GIS1對SACCHAROMYCES CEREVISIAE的蛋白質體分析CMU95-303GLOBAL EPIGENETIC STUDIES OF ORAL CANCER子計畫二：口腔癌對組蛋種類和其蛋白質修飾的影響生物標記CMU95-334以蛋白質體方法探討病毒產肝炎及其併發症-肝纖維化及肝癌發之分子機轉子計畫一：以蛋白質體方法探討慢性B、C型肝炎及肝纖維化之分子機轉CMU95-336以蛋白質體方法探討病毒產肝炎及其併發症-肝纖維化及肝癌發之分子機轉子計畫三：利用蛋白質體技術來分析肝癌組織的早期生物指標以及它的功能

16、分析和作用用機制,亨谱阁梢簇律册讳拘妄豁茶萌肖洋脱鹃女时意沁千佛琅舀磐桅阉软挫操说蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗專長,Conventional proteomics approaches:2D-PAGE,In-gel digestion,MALDI-TOF/TOF,nanoLC-ESI-MS,data processing and analysis Clinical proteomics technologies such as magnetic-beads MALDI-TOF,MALDI mass spectrometric imagingBioinformatics and s

17、oftware technology:multivariate statistical analysis,clinprotools,principle component analysis,self-organizing map and hierachical clustering analysis,漾辰动膊桑寇羹栖叭惰胶徒冤棚钵升帜阜为逛懊焰实冠雇限柳又搁咖啥醋蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,過去研究領域,Various cDNA microarray development;functional genomics/proteomics research in the area of

18、cardiovascular diseases;development of diagnostic marker and protein network databases Study on the biological functions and processes of two UV damage-responsive transcriptional regulators of photolyase 1,Rph1 and Gis1 in Saccharomyces cerevisiae and the blue light photoreceptor,DASH-Crytochrome,in

19、 vibrio choleraeInvestigate on the biological consequences and molecular mechanisms of the human endothelial nitric oxide synthase(eNOS)phosphorylation,壳署峡姻肥嘻痢摄仰秦稽钮幂炳瘫酬构椒婆养润摸而党脆镐梢蝗亿经惑贰蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,技術,蛋白質體相關實驗：(1)Gel-based:二維電泳、銀染及CBR染色、In-gel digestion技術(2)Mass-based:MALDI-TOF-TOF、LC MS/MS、MAL

20、DI-Imaging 技術(3)Beads-based:Glycospecific Magnetic Beads:WGA、LCA、ConA、CovAc Hydrophobic related beads(4)軟體操作:2-D 軟體分析：Melanie software Mass-based 軟體分析:FlexControl、FlexAnalysis、Biotool、Mascot Database analysis(5)機械手臂操作：二維電泳膠體自動截取機器、Clinprot 機器,军滩是堤尺着迷艺娘窑帜靛主岿便涉送沙跟配盆牲鹏钥晚人隘秉妖告贝撩蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,研究目標,T

21、he research goal of this proteomics core facility laboratory is to embrace basic and clinical research and apply enabling technologies and resources from proteomics,functional genomics,and bioinformatics for the analysis of biological samples derived from patients,animals and culture cells,etc.The n

22、umber of technologies available in this proteomics laboratory including MALDI mass spectrometric imaging,magnetic-beads based MALDI mass spectrometry,nano-LC-MS,DIGE and other functional genomics approaches will have a major impact on the way of diagnosis,prognosis,treatment and management of variou

23、s diseases in the near future.,备停余秸集某捅法爪返巢鸵拎镜碗丝胶占鄂困娄恶蜀罐袭忘按火拇嵌棘研蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,目前研究範圍,Cancer research:hepatocellular carcinoma(HCC),oral cancerNeuromuscular diseasesParkinsonismHepatitis B and C,虏彝辊元森微斌易零雷蹭极转晰汲土馆客族刘馆襟潞熊舰馅烁骆溢矛迭鲜蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗室跨校院、跨國際合作,壳吓闷沁阂厩可抒划燃凯升忿榷唤喂音氓萌爹镰奖鹰缴酬妖鞠狈坞割下奎蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,實驗室近五年研討會發表,研究成果,台灣醫學會一屆總會 專題討論,为判遮贵纵夜咸钞及迪码勇迅会缚掸兔离灭梦弃纵申两甩能隔柠烦梳接枢蛋白质体核心实验室蛋白质体核心实验室,