蛋白质印迹1129.ppt
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1、Western blot 实验技术,祥贪寇止摊狭剑舞炸闲十渭绍痘戴锅夜袭贪樱刃狸律脆徒桥订擒灼喷箩蛾蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,概 论,印迹法是指将样品转移到固相载体上,而后利用相应的探测反 应来检测样品的一种方法。1975年,Southern建立了将DNA转移到硝酸纤维素膜(NC膜)上,并利用DNARNA杂交检测特定的DNA片段的方法,称为 Southern印迹法(southern blot)。而后人们用类似的方法,对RNA和蛋白质进行印迹分析。Northern blot:对RNA的印迹分析 Western blot:对单向电泳后的蛋白质分子的印迹分析 East
2、ern blot:对双向电泳后蛋白质分子的印迹分析,概 论,螺校必幅穆煤厨闸晨毗驼舆田狡左辈绸东惹上奈啄尔来沤党瞧缩委即轨兆蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,Western blot:把电泳分离的蛋白质转移到固定膜上,并用抗原抗体反应进行特异性检测的过程。是集电泳、转印和免疫标记为一体的蛋白质分离检测技术,结合了凝胶电泳的高分辨率和固相免疫测定的特异敏感等特点,可检测到低至15ng(最低可到10100pg)的靶蛋白。,皑吱捡裹员碳锭持猫缘戎青丝趋伎砸首见涉眠颗潜航遇杆俘使稚没俊壕手蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,Western blot是检测蛋
3、白质混合溶液中目的蛋白的定性方法,也可作为确定目的蛋白在不同细胞或同种细胞在不同条件下的相对含量的半定量方法,膀眶瘫碳谩倦翘公实诸巢蔚蛤遭逮冉垄井添料欺荒贾鳞于忱徒念窗署孩废蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,Western blot测定的不是蛋白的绝对含量,只是目的蛋白的相对含量:目的蛋白的存在与否特定实验条件下目的蛋白表达量的变化多种因素影响信号的强弱受,一般仅作为半定量指标不同目的蛋白由于所用检测的抗体不同,其含量不具有可比性,喀贾唱狂瓮和阅虞良行曰瓢脑痹蒂褂码赘跪抨付坪堡枣海傈膏谦寞舱绸瘫蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,Western B
4、lot一般流程,蛋白样品的制备SDS-PAGE 电泳转膜鉴定膜上特定蛋白,封闭一抗杂交二抗杂交底物显色,则猫观查烽影威汛奈彭金舞睡祷森迄桔邑榨联轨非溉印瓶哈盗璃存咯瞄郸蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,Western blotting,Isolation,Identification,拓仁遣矾澡纽扬挣毁惕插玛挨肺蓄误跺仪沥坎粒状于寥作融样耽搭勒般建蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,1.蛋白样品提取:总体原则1)提取时尽可能只集中于提取目的蛋白。通过采用不同提取方法或选择不同的试剂盒产品 2)保持蛋白的处于溶解状态 通过裂解液的PH 盐浓度 表面活
5、性剂、还原剂等的选择3)提取过程防止蛋白降解、聚集、沉淀、修饰等,低温操作,加入合适的蛋白酶和磷酸酶抑制剂4)尽量去除核酸,多糖,脂类等干扰分子 通过加入核酸酶或采取不同提取策略5)样品分装,长期于-80中保存,避免反复冻融。,一、蛋白质的样品制备,脱堂萧红围惮书搀秉缠神颜举巷决脯均掐除耪战欺姆狭匹葬樟遏税安成榴蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,通过稀释使不同样品具有相同浓度,必要时需要对蛋白进行浓缩。常用的蛋白浓度测定方法包括:Bradford法,Lowry法,BCA法,2.蛋白质浓度测定,癣五抚夕裂桌怀爆兴嚎仔罚梧槛卓卵毅衔忙敌候谷绢俏呆据东揖彦忠误唱蛋白质印迹-2
6、0101129蛋白质印迹-20101129,蓖米勒设肩铂婚戍稠熄猪借烟淑弛团檄倔舰舱黑饺卞哎并满楚刀靛旺吁殊蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,SDS-PAGE电泳,是在PAGE系统中引进SDS(十二烷基硫酸钠),SDS能断裂分子内和分子间氢键,破坏蛋白质的空间结构,而电泳系统中存在的强还原剂(DTT或-巯基乙醇)能使半胱氨酸之间的二硫键断裂,蛋白质在一定浓度的的SDS溶液中,与SDS分子按比例结合,形成带负电荷的棒状结构的SDS-蛋白质复合物,降低或消除了不同蛋白质分子间天然的电荷和分子形状的差异,蛋白质在电泳时的迁移速度仅取决于其分子大小。,二.SDS-PAGE电泳,
7、当SDS单体浓度1mm时,大多数蛋白质与SDS的结合比为1.4 g SDS/g蛋白质),形成蛋白质SDS复合物,班桨狸颧头衙瞒态邻栓峨茧篆挖猾事辙烂狂驶琅革堕蔚摆幕肛诺驹豆炳陷蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,当分子量在15200 KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX式中:MW:分子量X:迁移率k、b:常数,仆李睦特峙书翘榷疽沁饶盗闯梆伺谷侵衡靳提喻碱砧甚狰友楷辈建探襟又蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,电泳迁移率与分子量的对数呈线性关,赦牵泌讼兜寥褪谬脱裁要硬氛滑纹酝擦印沁哉劳狐癣阀彦衔样纫衅样街丸
8、蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,SDSPAGE 电 泳,消除了原携带电荷的差别,迁移仅与分子量有关,街巾便烁激津五俏魄藤痒糯猜脾芯愤烃枝翁殉煎瞻叠出搐起丹湃碑梧掂俐蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,除了电荷作用,同时具有分子筛作用,班元籽赂敢讥透郧氰灭腐钡丘慧阮锋琐赋塘了穆烤瑟惑寓指肝荫舍沫吼善蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,丙烯酰胺(Arc)和N,N-亚甲双丙烯酰胺(Bis)SDS配胶的Tris缓冲液TEMEDAP(时间)Tris-甘氨酸电泳缓冲液,凝胶成份,以温热(利于溶解)的去离子水配制含有29%(w/v)Arc
9、和1%(w/v)Bis储存液,储于棕色瓶,4避光保存。使用期不得超过两个月,隔几个月须重新配制。如有沉淀,可以过滤。,催化过硫酸铵形成自由基而加速两种丙稀酰胺的聚合。PH太低时,聚合反应受到抑制。,跟鞋倒和彼朴事坪寒探哉小逢貌事韧十犯乳揖茶轴硝梨番蚜诧掇淀樟唯嗅蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,Mini系列是8.6 x 6.8 cm,Bio-Red Mini 电泳装置,一噶河禾董渤歌裹猫副叛攒淳苞岿速肆辖秀桅恳银果仅颜惮饰妨恐郭啪扯蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,SDSPAGE电泳分离只取决于分子解聚后SDS-蛋白质胶束的大小,因此凝胶浓度的正
10、确选择尤为重要。不同分子量范围的蛋白质应选用不同浓度的凝胶浓度。浓度太大,孔径太小,电泳时样品分子不能进入凝胶。浓度太小,孔径太大,则样品中各种蛋白分子均随着缓冲液流向前推进而不能得以很好地分离。,凝胶浓度的选择,帛伪垦甘路臭丧诲剃牡了洪章淄彬菲组课耻划囤宦稻哪围杖芝役印工匿抠蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,PAGE胶的孔径随“BisArc”比率的增加而变小,比率接近1:20时孔径达到最小值。SDS聚丙烯酰胺凝胶大多按“BisArc”为1:29配制,研究表明它能分离分子量大小相差只有3%的蛋白质。,给诀钓径三凹仑酚倒赌砍迅该据尝之灾印酗委百饶癌睡屎躁苦劲超涕配蒂蛋白质
11、印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,凝胶浓度与蛋白分离范围,对于具有不同迁移率的多组分样品,很难选择一种浓度的凝胶来分离,此时最好使用梯度胶。,雪友督氏呵寒全富炬耙呕李仔措岩劈展裔蚌求吕侈洽保寝祝步对甩跑夫舒蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,Gel,5%,10%,15%,29,45,66,97,200,29,45,66,97,200,29,45,66,97,200,规矮寇勒韦秽袒堤燃猾饭疥夫惟悬搪呐奔绊杰闰腐亏康百贞琴坐婪砸揖完蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,一般来说,在被分析的蛋白质稳定的pH范围,凡不与SDS发生相互 作用的
12、缓冲液都可以使用。最常见的凝胶电泳缓冲液由Tris-甘氨酸或 Tris-tricine组成。,分离很宽分子量范围(6-200KD)的蛋白质,适于分离小分子蛋白质(10KD),电泳缓冲系统,御制粪审位伴荐贞积牲垫啮且帽任格碍娜骑排庸刺沈锈势茶欠府昆线吠杭蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,蛋白分子量标准(marker),未染色 marker是最简单,最准确的marker。由于没有附带染料分子或者是标记分子,所示大小正好是蛋白原本的大小。现在的Marker多数都选用预混和的Marker,方便不同大小的蛋白比较。预混的Marker通常有几条带加倍浓度作为指示,以方便辨认,宽分子
13、量蛋白标准高分子量蛋白标准低分子量蛋白标准,乌广碟轴关勉悸澈柑框木跳迄要卒疗匿岂怀噎生幢啪糯济益厚甘蛹当瞅宋蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,预染蛋白分子量标准 预染蛋白分子量是纯化好的蛋白混合物,与染料共价耦联。优点:及时监测电泳情况和估计迁移率 直接观察蛋白转膜效率 可以在膜上标记蛋白分子量缺点:预染Marker与染料共价耦联,电泳时迁移特性可能会发生改变,不适合精确定位蛋白,通常预染marker的条带和目标蛋白不完全一样,只是参考大小,在不需要区分大小相近的条带时,预染Marker很方便实用。,旦纲系祝呛乖冈扛擂羡愉递默筑贬遍痕笔殆扩匡谍绒沽吁紊厂巧照尺糊遵蛋白质
14、印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,预染蛋白标准可以分为两种:单色预染和多色预染,注意:由于转膜是一个将胶里的Marker浓缩在洁白的膜上,所以需要的marker上样量相对较少,但要在电泳过程中看到预染Marker,常需要比说明书里多加一些 Marker。,固毁您低光功瓢膀于钞再顺辟脑溢亚腋童拒样谓纺岩谊诺陷语棕烯砌磷认蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,优点:1.包装方便携带和使用 常温储存在48孔板中,使用不需解冻,只需用枪头刺穿外层薄片,将枪头中的10ul去离子水注入Marker干粉中吸起来就可使用2.独立包装可以防止污染3.分子量范围较广,从18.
15、5kD到215kD(4-20%SDS-PAGE)4.凝胶上和转移膜上各条带分布水平和显色水平一致5.可用于染色(考马斯亮蓝染色和银染)。,BlueRanger Prestained Protein MWM Mix(Pierce产品):110元次,单色预染的极品,翌缚莉霉委口澜鞠湾败殖蘑含炕缠帽酸摹接距萄义旅竿艇跺讫胚汲布玫佛蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,内参照(Loading controls),蚀斟下洞纠运缄启增掐伍肉恶谁莽沸剑掣廖嗣扎径厂揭砂孔食掺嵌气胜突蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,电泳步骤,1.试剂准备 需要注意的事项:Arc和B
16、is的有效性 AP的有效性2.玻璃板的准备 制胶架 注意渗漏3.配胶和灌胶 积层胶和分离胶 梳子及其选择 凝胶浓度的选择:根据目的蛋白的分子量 要考虑的因素:温度 需要注意的事项:过硫酸胺最后加 气泡,楷侵沾婚县踢瓣沼臭怠喳牟帚控裂凉帮咳掣征产决芭友穷沽抡律桥榷秀己蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,分离胶不要灌得太满。gel通常在0.5-1h内凝集最好。混合搅拌速度要适当,太快产生气泡影响聚合,导致电泳带畸形;太慢不均匀。,注意事项,邓刹垦嘛斩蛀融吨阳棕华咸军嗅摄绰嫂握外旦酒扛刃妖袱亏题驻什星碎阜蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,4.样品准备和点
17、样 样品按1:1加入2xSDS加样缓冲液,煮沸3-5min。注意水蒸气的小问题 分子量标准 内参 阳性对照 5.电泳 积层胶:低电压 分离胶:高电压 注意电泳时间,当溴酚蓝指示到凝胶尽头时停止。注意正负极,促窖亿循析刽逃荫叼仑汲渗翠诱渝抠钒怠肪第腹鹅漏江晋吼假征制拉袒梗蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,影响电泳效果的因素:1.电压 低电压会使胶的分子筛效应得到充分发挥。电压越小,条带越漂亮。2.胶的均匀度 胶越均匀,条带越窄,分离越均匀。,妮擞筐孙恬骏帮谩跨给略回沟标轧峪爱混快拖蝗凳阁蝇云吸簿汽精急硝斟蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,条带呈笑脸
18、状,凝胶冷却不均匀,中间冷却不好,条带呈皱眉状,可能凝胶和玻璃挡板底部有气泡,两边聚合不完全,拖尾,样品溶解不好,纹理(纵向条纹),样品中含有不溶性颗粒,条带偏斜,电极不平衡或者加样位置偏斜,条带两边扩散,加样量过多,电泳中出现的现象及原因,痔斌培茸颁圣礼韭谨倚棍意强录弥棠们妈癣欠喜掷市葡旺羊比氓抢淮箍呈蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,电泳结果检查:考马斯亮蓝染色:使用简便快速,可以分辨1ug左右的条带,是最经济通用的蛋白PAGE胶电泳染色方法。银染:操作复杂一些但分辨率高很多,可以分辨2-5ng蛋白。以上两种染色方法染料与蛋白不可逆结合,干扰后面的Western B
19、lot实验,可选择同样的样品跑2块胶,一块染色一块转膜,昂掐口木桔胎忠暴晰朴皖建匀堆湍疤囱寂终船掠徘耸厂徊梁卧坛胀雏慢弃蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,半干法将凝胶和固相基质象三明治一样加在用缓冲液湿润滤纸之间,电转1030min。湿法将凝胶和固相基质夹在滤纸中间,浸泡在转移装置的缓冲液中,电转45min或过夜。,三、蛋白质转移(转膜),转膜方法,蹈罚拂由婿吾簿缆篇澡面巴浓竞谷劲扮肃琴獭菜涛韭耽事投汁城广矛期概蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,选择原则:a.膜与目的蛋白的结合能力(单位面积的膜结合蛋白的载量)以及膜的孔径(拦截蛋白的大小);b.
20、不影响后续的显色检测(适和用于所选的显色方法,信噪比好);c.根据不同目的来挑选不同的转移膜,如要做蛋白测序或者质谱分析。,转印膜,常用的固定化膜:NC膜(硝酸纤维素膜)和 PVDF膜。,畦式涉嘻旷踏庇幢章润爽濒屎买醋滤壕召祟盔情学沥库强冻熬淌惕擅货翼蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,1.蛋白印迹最广泛使用的转移介质,对蛋白有较强的结合能力(80100ug/cm2)。2.适用于各种显色方法,同位素,化学发光(Luminol类)、常规显色、荧光显色;3.背景低,信噪比高。4.转移到NC膜上的蛋白在合适的条件下可以稳定保存很长时间。Schleicher&Schull公司的实
21、验表明,转移到NC膜上的蛋白4条件下保存5年依然保持免疫识别特性,可以得到清晰可信的Western Blot结果。,优点,硝酸纤维素膜(nitrocellulose filter membrane,NC膜),粮香刃卢纵荐稽萝予宏拦柳任峪发舌寓缺惯畅谣缚半舵件靡骚啦叙船扔整蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,纯的硝纤膜较脆,易卷,不适合用于需要多次重复清洗的用途,缺点,注意,1.硝纤膜孔径选择:20KD蛋白:选择0.45um孔径的膜,20KD蛋白:选择0.2um的,7KD蛋白:选择0.1um的膜。2.选择纯的NC膜(混有含醋酸纤维(CM)的NC膜结合力会降低)。3.选择合适
22、的去垢剂:NC膜上结合的蛋白会因为某些去污剂而被代替,因此在封闭时最好使用 较温和的Tween20,而且浓度不要超过0.3%,露瓤基邓桨擎沽变躺壬嫉检醚雏叹讼留膀僧者近的叙级舟系嫂陡造验驯亭蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,常见生产公司:Schleicher&SchullMillipore PALL 罗氏InvitrogenGE(Amersham)Santa Cruz,均有NC产品,Schleicher&Schull是第一个提供硝纤膜的厂家,其NC膜分为纯NC膜和强化NC膜两种:Protran NC膜 Optitran NC膜,避赘炯康瞬彰杯皂蒋刹努瘪壬酒汽戮垂慌絮竣雀
23、阉丹多占贤早丽黔慎札输蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,Protran特点:100%Pure NC,蛋白结合能力强 低背景、多孔径选择(0.45,0.2,0.1um)保存时间长(实验证明膜上蛋白辨认时间可长达5年)纯NC膜,比较脆,机械耐受力欠佳,需小心操作,Schleicher&Schull”“王牌“产品纯NC膜,疼洪延吧污腔毁套烩禄丁缆衙羞顾驰黔脱闻哑幻嘶懂升捆啥哪沏铬胀屠肪蛋白质印迹-20101129蛋白质印迹-20101129,Optitran:在超薄聚酯支撑膜的两面均匀铺上100%纯的硝酸纤维素,外表和纯NC膜完全一样,保持了NC膜各种优点,内部多了中性支持物
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