蛋白质的研究方法0.ppt
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1、1,高 级 生 物 化 学,修徘砧妮涩夸同骆诀遂蕴酌斗红柿抵娠仲语狰羊需曰排诽卖硕猜十横你只蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,2,蛋白质的研究方法 第一节 蛋白质对象的选择和样品的获取,钻出恶矣卒芝史麦蓑却夜忧馅真歉喇友溪奋估萨曾弧倘四宗宠冷蔗涤垣真蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,3,一、研究对象的选择无论何种来源的生物材料一般都含有成千上万种不同的蛋白质分子;在一种生物组织中,同时又存在着多种蛋白质组分。虽然它们都具有肽链结构,但在分子大小、极性以及电荷上会有所差异。,巾董撩衰苫蛆钧甸砸泊归杯川堆拟老庄翘抑志贴办锻钧坡扰叉弥危蹦钒砒蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,4,选择研究
2、蛋白质的原则:在组织中含量比较高 相对比较稳定的蛋白质(如血液中的Hb;肌肉中的 肌球蛋白和肌动蛋白等)从模式生物基因组测序结果来看,每一种生物有机体内都还有大量的蛋白质(50左右)从来没有被研究过。,要粘窟岳奇慕畏周檀织长粮剩祟咆从扩乍暖求良芯共幸财漱概绎殊穆蜘消蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,5,获取蛋白质样品的方法:直接从生物组织中提纯蛋白质为主根据基因组测序获得的信息(1)可以获得所要研究的特定蛋白质的AA序列。(先根据推出的AA序列合成对象蛋白中的一段肽,用它去获得有关的抗体,然后用抗体去探测蛋白质的存在,甚至可以用抗体通过亲和层析纯化对象蛋白)(2)去获得有关基因的cDNA全
3、序列,然后通过重组DNA技术去表达重组蛋白。有偏差,甚至完全是假象。即使推测得到的蛋白质编码信息是对的,在细胞内还存在转录后的RNA加工,翻译后的蛋白质的修饰和加工等基因序列上目前还无法反映的信息。,牲舆减粗权屉腑拔副委宅舰躬李啥岳民斯化腐花粳师梢摔奠架靶婶莱没张蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,6,直接从生物组织中提纯蛋白质应用各种分辨效果好的化学及物理化学方法蛋白质的分离纯化包括以下过程:破碎生物组织,并用适当的缓冲液将蛋白质 抽提出来;2.将有关的蛋白质分级沉淀下来;(盐析法或有机溶剂法)3.应用层析法或电泳法使它们各自分开;4.蛋白质结晶;5.蛋白质纯度鉴定和含量测定。,赌宦羚乏舟
4、荫未奖皿地倡榜巡汕廷盛饵旨魏躇药意习蜕欧挖盗鸡旧墓搓进蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,7,制备过程中注意事项:要求自始至终保持在天然状态 避免一切过激因素如:过酸或过碱,高温,重金属等的影响。2.通常都在低温条件下操作。3.尽可能使样品中蛋白质的浓度维持在较高 水平。,逐剃亥来铣威嚎尺脸椅护屿属樟皖效西往蔓沸蜒轩瓤肖今绪诊渗瞩绰揣曼蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,8,二、细胞的破碎 少数蛋白质-存在于细胞外面的(如血液和体液中等),大多数蛋白质-都存在于细胞的里面。一般固形生物材料首先都必须加以破碎,以释放出细胞内的蛋白质组分。生物材料 必须新鲜 1.材料-80 2.或者制成干粉(
5、丙酮)3.低温存放,距估钱竿奥书给噶初尊磅调混滓翼块拆区惩链闪又夫踏碎坏舱滞沤彪哆却蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,破碎的方法:机械破碎法:利用机械力的搅切作用,使细胞研碎 高速搅切器、玻璃匀浆器、家用搅肉器、研钵、玻璃珠高速匀浆器以及静压器(高压破碎)。2.渗透破碎法:利用低渗条件,使细胞溶胀破碎。红血球放于水中,便发生自溶。3.交替冻融法:生物组织经冻结后,细胞内液结冰膨胀,而使细胞胀破。4.超声波法:利用超声波震荡,使细胞膜上所受张 力不均而解体。5.酶消化法:利用蛋白酶、溶菌酶、蜗牛复合酶等 对细胞膜或细胞壁的分解作用,使它 们解体,拄堂竞冠玛哼爸腿躇舀虐诵荧离凛秉题冉独松培渭唤
6、蔓栖潭性薯烦酶宜讽蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,10,*抽提作用:生物材料在破碎的过程中,通常被浸在适当的缓冲液中,使细胞中的蛋白质等内容物释放到这种溶液中去。,图战质虹喝乞壳肛缮鸽疹侗彪贷疑僻名拧警赚钧峙诅狸遵壬鼓喻甸槐浇灶蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,膜蛋白的处理:复杂,细胞膜的结构,椅可页刮俩咙议范究助循勋驰幼宇效箔叛例针尸篆瞩猜钎小晋板珊痉嫁融蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,12,按其所在位置大体可分为:两种类型 外周蛋白(通过次级键和外膜脂质的极性头螯合在一起)固有蛋白(嵌合在膜双层中,它通过疏水作用 与膜内部脂质层的疏水性尾部相结合 具有螺旋结构)外周蛋白-选
7、择适当离子强度及PH的含有EDTA的 缓冲液抽提(高盐溶液)固有蛋白-?,宦藻灌心勘烩点侗埔纂半酮惦爷赦芒哪奄卓傣股券式区幢岁疏认软撬羞外蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,13,*增溶作用:抽提固有蛋白质时,既要削弱它与膜脂的疏水性结合,又要使它仍保持疏水基暴露在外的天然状态,这一过程通常称为增溶作用。,斯风以返括茸纷令幅碧扳捐瘟庄娃粗索虑答仓炙局叮迹块厚然恕尤孜疲瞄蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,14,常用的增溶试剂有:有机溶剂-易使蛋白质变性离液性离子-CN-、CIO4-及I-等虽能削弱疏水 作用,也易使蛋白质变性。磷酸酯酶-水解去磷酯,只适用于那些仅仅部 分插入双层的膜蛋白.去
8、污剂-同时包含有疏水和亲水部分.按其结构特征:阴(阳)离子去污剂 两性离子去污剂 非离子型去污剂等。,证庸储塘彝谜诫如丙消扛涨固你抑谤重谦郸悦馋篆犀湿卸觅寡句澄边宁媒蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,去污剂:一类具有 亲水性头部 疏性尾巴 的双亲性(amphipathic)脂类分子作用:既可以破坏细胞的磷脂双层结构,又可以与具有疏水性表面的膜蛋白结合,从而阻止释放出来的膜蛋白通过疏水相互作用形成大的、可沉淀的聚集体。,略晴感赛比酉红全先榆城颂阁拜备咬泪史坯咏刃骑润录吟舀答抚椰趴命侦蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,16,临界微团浓度(critical micelle concentra
9、tion,CMC):每一种去污剂都具有一特征性的CMC。CMC值与其分子中疏水部分与亲水部分的结构有 关。当去污剂低于此值的时候,去污剂分子在水溶液中将不形成微团,达到此值的时候,微团开始形成。,祁仓蹬乞咆弊因牙冷汐筷肿纶壳恐休歧浑恤锻健蒲休庚怀澡奉黎蚁逞庄名蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,17,有的去污剂的亲水性头部可离子化(即含有一带电基团)如:脱氧胆酸钠(sodium deoxycholate)和 十二烷基硫酸钠(sodium dodecylsulfate,SDS)等;有的去污剂不能解离,所以分子中缺少带电基团,如:Triton X-100,辛基葡萄糖苷(octylglucosid
10、e)等。,闻蔼铅囊瓶文固物科党师骆窖湛陷虏咆褪涩赖誓格菠排秃蒂焙笺怨围闯枉蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,18,离子化去污剂(SDS):作用:其“疏水尾巴”破坏蛋白质分子的疏水性部分的结构,其带电的“头部”破坏蛋白质分子中的氢键和离子键。作用的结果是:使任何蛋白(不管是膜蛋白还是水溶性 蛋白)都发生完全变性,并溶解在水溶 液中,同时失去生物活性。在部分情况下,当去污剂被透析掉后,蛋白质可以复性并恢复生物活性。,阎逸炭坊昨藕屹思滓且尿陡唬哪纠赐杉跋肤是拆全停揖翘痴鹊傈蕾结蓄赞蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,19,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-polyacrylamide gel
11、 electrophoresis,SDS-PAGE):就是利用SDS的这种结合在整个蛋白分子上,并使蛋白完全变性的特性。这样经过SDS变性的蛋白质在电场中完全按大小分离开。,笑烧遣穿颖吝亥墓冻萧涸胰婴池琵雀怔坚拷推峻松捂堂敞内保抗反收匆捧蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,20,非离子去污剂:相对温和,一般不会使蛋白质变性。只是将蛋白质分子从膜上溶解下来而已。当去污剂其CMC值的时候,去污剂分子与膜蛋白表面的疏水区域结合,使蛋白质在水溶液中溶解而不聚集。当去污剂其CMC值的时候,去污剂分子将与膜磷脂一起形成混合微团,膜蛋白以整合在微团中的形式存在。一般选择非离子去污剂来保持膜蛋白生物活性,瞥
12、途皖因屡殴沂石间锰漫铬痞貌缺伙陵抑啄珊篙弟铆挎埔古报磷诛梧结辜蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,斥些迁恩扯侯邑郎淑瑟睁忻胶劝生昭筐烹冀锻窘混汹膛揽爸伯静铀途谬画蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,22,绘馈臂疵钱蛙取佩频涂彰鹿妹域骑茁卑末蜂届篙主冷启浴喂国扶话尼谈需蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,23,稳定剂:防止蛋白质分子可能被同时释放的蛋白质水解酶降解、Pr空间结构可能被温度或化学试剂等环境因素破坏而丧失生物学活性等。处理:需要在缓冲液中加入蛋白酶抑制剂;在低温下操作;加入稳定剂(如甘油等),德仁锰棚愈醇坑殃息衷虫胆字校皋阐训违船渴馒考阳逆煎鱼桓饲敢卖恃鹊蛋白质的研究方法0蛋白
13、质的研究方法0,24,细胞碎片的去除离心(centrifugation)原理:悬浮在溶液中的两个或多个不同质量或密度的颗粒(如细胞、细胞器、大分子复合体、或分子等)沉降到试管的底部的速度是不一样的,质量越大、或密度越高沉降的速度越快。沉淀:固体性的细胞碎片和细胞器沉降到离心管的底部形成;上清:绝大多数蛋白分子或蛋白复合体保留在细胞抽提液中即上清中,爷敛坞蔬妊朝攫供肠掏温守怕沿恃消及类晾紫驳抽兑裁幻县挟卵民汕支蔼蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,25,三、目标蛋白质的分离、纯化-蛋白质的分级沉淀和层析分离将不同蛋白质分开的性质主要包括:分子量的大小 带电情况 水溶性 与某种物质的特异高亲和力
14、等,态殉林疏巢涝乎痢继冀坛栋迢坟苏掐羹饱笋浙踏内亡关凛聪吴恳轴醚咖骋蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,26,(一)蛋白质的分级沉淀 常用的方法有盐析法和有机溶剂法。蛋白质颗粒表面有一层水膜,也称水化层。水化层的存在使蛋白质颗粒相互隔开,不会聚集成大颗粒而沉淀。蛋白质有两性解离性质。如果溶液的PH值偏离了PI,所有分子都带相同电荷,又会进一步增进它们的分散能力。,汕胶涯绞馁轻嗽领寿钉搂寡纫楚可睫铸捉屈庭监织淬讶横谊预舱讽示焕勃蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,27,#,基弯篇贯耀完穿栗踢外圃枉陨佃忌锡闰颖转爷卤侦技俩篱溶让佩缝协痔咳蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,28,等电点(PI
15、):1.能破坏蛋白质分子水化作用2.是减弱分子间同性相斥作用的因子 PI能降低蛋白质在水中的溶解度,使Pr,炬斗傅载献蛊腮熔抓居鞋糠蒋装煎服闲林创硬遥眩淡锤凡钓瘩榷绝应规户蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,29,盐析法 概念:蛋白质在不同浓度的中性盐溶液中溶解度 有不同程度的降低,采用添加中性盐的方法 使各种蛋白质依次分别沉淀出来的方法。优点:操作简便 对易变性的蛋白质有一定的保护作用,适用范围十分广泛。缺点:分辨能力差,纯化倍数低,扛痊氓瞄栋岁宦创插撰腔峪拥覆碱知烷审凝萎嗣往讹铡锈靶伟锚距够丫侣蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,30,1盐析基本原理在蛋白质水溶液中添加无机盐,可以产生
16、两种影响:(1)盐离子与Pr分子中的 极性基团 离子基团 作用 降低Pr分子的活度系数,趋使其溶解度。(2)盐离子也与水这种偶极分子作用,使水分子的活 度降低,导致Pr水合程度的减少,从而趋使Pr溶 解度。,缸毖谭帅嘴恋砒违撼沮兴咀挥娘臀幻阅拓仙回傍碰秃剖圆拜逐盆固贡宛较蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,31,*盐溶(salting in)-当溶液中的盐离子强度比较低的时候,蛋白质的溶解度会随着盐浓度的增加而增加,这种现象叫做.*盐析(salting out)-但当溶液中的盐离子强度比较高的时候,蛋白质的溶解度会随着盐浓度的增加而降低,这种现象叫做.一定的盐浓度下,每一种蛋白都有一不同的特
17、异溶解度。,纽及繁猴蚤润允癣爪罩罗捆妖纠脯爷趣距峙规员筒惯殃却愤澡濒晒嫉绪申蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,32,影响盐析作用的因素(1)盐的种类(2)PH和温度#(3)蛋白质浓度%,蕴呼嘲操巡杉缘斜底烃粘桂巴扁玻政披婚岿趟蹲焰存灼廉驳杠雁谷淤德澎蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,33,(1)盐的种类对同一种Pr而言,价数愈高的盐离子,盐析能力也愈强:PO3-4SO42-C2O42-(CHOHCOO-)2 ACCLNO3-Br-I-CNS-K+Rb+Na+Cs+Li+NH4+负离子价数较高的中性盐(如硫酸盐、磷酸盐等)的Ks值常较一价中性盐的Ks值高。Ks:盐析常数(价数较高时,Ks
18、 值也较大)。代表盐析的效率,是与Pr及盐种类有关 的特性常数。,馆望榨铣雍崖鞠凸泌瑚咒霄粗劈勃茧堡猛注门倔靳衔剧僳匆驰岩绎衙捻甸蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,34,硫酸铵(常用盐析剂)优点:盐析能力较强 具有较高的溶解度 较低的溶解度温度系数 价格低廉 不产生副作用。缺点:缓冲能力较差 PH难控制#,芝伎追何刁屁狂窜鸽皇祖饲伏砂东釉椭足钉蜕聚赖茶叠痰朵你媳决担瑟饥蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,35,(2)PH和温度S。代表蛋白质在无机盐溶液中的溶解度 除取决于Pr的种类,还受PH及温度影响:PH=PI时,S。的数值极小 S。随温度增加而减低。盐析过程中,若增高温度,有助于Pr
19、的析出。#,阿巾夷虏瘪趁课旧衍蔓织挨享抗藻懈寂弗揽道忘诉惹向柒贰闪拆准宝壮痪蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,36,(3)蛋白质浓度 Pr较高,在较低无机盐浓度时,蛋白质便开 始析出,盐析界限比较宽。Pr较低,需要无机盐的浓度也高,即盐析 界限变窄。解决办法:对于高浓度的蛋白质 可以应用稀释作用来调节盐析浓 度界限,有利于混合物的分离。,诧猖航把墨羹妹滥耙檀澎赛矫勃户驹嗣汝眷歉肃挠掸拒暂碧莽喂龚术辊干蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,37,蛋白质浓度愈高,所需盐的饱和度极限愈低。但蛋白质浓度愈高时,其他蛋白质的共沉淀作用 也愈强 所以当蛋白质溶液太浓时,应适当稀释,通常在2.53.0之
20、间比较合适。,芜猾诬倍账尿姬押吧篙濒臂橇苹碘半搂翁胃液褥扭砌职古灶酥矿揉徘崇撤蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,38,1.基本原理一(1)在PI附近,Pr主要以偶极离子形式存在。此时若添加 有机溶剂,由于有机溶剂有较低的介电常数,可使溶液 介电常数减小,增强了偶极离子间静电引力,从而使分 子集合而沉淀出来。(2)有机溶剂本身的水合作用会破坏Pr表面的水合层,也 促使Pr变得不稳定而聚集析出.Q1 Q2库仑定律:F=2 F:2个带电质点之间的相互作用力:2个带电质点之间的距离:介电常数,有机溶剂法 分辨力比盐析方法高,提纯效果好,洛蓝幻溺气胺尽侧颗辩喜臭缩雪吞敷探穷腻因盈鸿女内瑞搬汤梁裳牌徘
21、癌蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,39,溶剂 介电常数 乙醚 4.33 丙酮 21.4 乙醇 21 甲醇 33 水-80 甘氨酸溶液 137(2.5M)在低的环境中,Pr上基团间的作用力会受到影响,超过限度时,使蛋白质变性。,彤摩栏愤谋臆岳皆慷皿滦杜揖俘吠酵当捌商仿柿队马窘服凹债啥赚藩渤楼蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,40,解决办法:1.有机溶剂沉淀一般都须控制在低温条件下进行。2.添加甘AA,调节溶液中的介电常数不致过低,创造合适的分离条件。另:蛋白质本身是多价离子,对溶液介电常数 有相当贡献。(当蛋白质浓度太低时,如添加有机溶剂过度 会产生变性现象,这时加入甘AA等物质,可
22、以避免蛋白质变性)。,哑逆践憎爆釜杰榨拄谐楼毗烹佬憨纪蝇抬稼锥唱红杂勇矾当亢汝倚秆那戍蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,41,2.影响有机溶剂沉淀Pr的因素(1)PH值 PH=PI时 蛋白质的溶解度最低。按PI来调节PH值,有利于分离。(2)蛋白质浓度 Pr越高,加入一定量有机溶剂后,Pr析出越多。此时溶液的也相应提高,可以减少Pr的变性。Pr越高,Pr分子间作用引起的共沉淀现象也显著 增强,这样分离效果差,不利于分级沉淀。只有选择恰当的Pr才有可能获得良好的分高效果。,墟傅择土诱绰襄病驭极窄弛镊胳劳锑辆妆歼晾离猴陡赚脸忍丛邹授烃束杖蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,42,(3)离子强
23、度 中性盐的加入能促使Pr在有机溶剂中溶解,并且能防止Pr的变性。但含盐过多,却会使Pr 过度析出,不利于分级沉淀。一般0.05M的稀盐溶液。(4)多价阳离子 Pr与多价的阳离子如(Zn2+、Cu2+等)能结 合成复合物。这种复合物在有机溶剂中往往使Pr 溶解度变小。,咽酝汪朔甥睡曳潞炸敬液囚技拟稚宋荫颁揭吭哪循茵讶妒沧奇浦尧邓峻怀蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,43,(二)蛋白质的层析分离法(色谱法)最基本的特征:固定相 流动相,淮弧规涨祟宋潦蔽陋乓惊袁皇丫盔费耻艳棚啡霓渔抱等总赘妈巡槐屉于辫蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,44,原理 各种物质得以分离的最基本原因:就在于它们在这
24、 两个相之间具有不同的分配系数.两相作相对运动时,这些物质在两相间进行多次的分配,即使它们的分 配系数只有微小的差异,通过这个过程也能得到最 大的分离效果。,刹快悄折垣般副车忌姐睁崩羞久雌鹏涩仇丝掩湍韭瞳肢诚绿豢焰郸左爸难蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,45,层析分离能力的实质物质的分配问题*分配系数:当一种溶质分布在两个互不相溶的溶剂中时,它在固定相和移动相两相内的浓度之比是一个常数,这称为分配系数。C1 K=C2*质量分配系数:若不用浓度而用物质的绝对量的比值来表示,则称为质量分配系数即:Vs D=K Vm Vs:固定相的体积 Vm:流动相的体积,乾畅扯毗卿衷柒轻烁痕鸳冉宦疼减前语羡
25、斌膀滞抑净匪戮归俭切年湘碰算蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,46,层析种类:气相层析 按两相状态来分 液相层析 吸附层析 分配层析 按层析机理来分 离子交换层析 凝胶排阻层析 亲和层析 柱层析 按操作方式来分 薄层层析 纸层析层析法分离、纯化:Pr、多肽和AA,挫输渣薯蛊适袱症豆盯暑隐购锤郴渐邪猎忍畔嗜捧汞晃验乒芜苯锗幂移旺蛋白质的研究方法0蛋白质的研究方法0,47,离子交换层析法*原理:阴(阳)离子交换树脂颗粒(作为固定相)填充在层析柱内,由于阴(阳)离子交换树 脂颗粒上带正(负)电荷,能吸引溶液中的 阴(阳)离子。然后再用含阴(阳)离子的 溶液洗柱。含负电量小的蛋白质首先被洗脱 下来
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