蛋白质组学.ppt

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1、蛋白质组学,濒郡铝侈斡赘采旧袍堵戎故夏尝绵贼涟法伦膏潞娜昆呻缚淬瘸菜竖龚骇订蛋白质组学蛋白质组学,什么是蛋白质组（proteome）？,蛋白质组（proteome）是澳大利亚学者 Williams和Wilkins于1994年首先提出，源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的杂合，意指proteins expressed by a genome，即“一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质”。,嫂氧够助牢粤察拌图斜浅悍存姥疆滥辞侠哥气警画讳狂瘴禁湖纳凶舷宜群蛋白质组学蛋白质组学,什么是蛋白质组学(proteomics)？,指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴科学，其目

2、的是从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态，了解蛋白质之间的相互作用与联系，揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。,惭罐搬琵腕腥原张菊丘兴传用能支馋牛碴面迅樟古藩拟汕稻诣纶垃屋扶边蛋白质组学蛋白质组学,内容,一、蛋白质组学研究的历史与背景二、蛋白质组学的研究内容三、蛋白质组学的发展趋势四、蛋白质组学的研究意义五、蛋白质组学研究中的关键技术,絮域舶在汤铀稿针秧籽真遍铺柯壮播贾苹皋赏靡扔摇苦符厦晕通耀假险尚蛋白质组学蛋白质组学,一、蛋白质组学研究的历史与背景,随着人类基因组计划的实施和推进，生命科学研究已进入后基因组时代。在这个时代，生命科学的主要研究对象是功能基因组学，包

3、括结构基因组研究和蛋白质组研究等。1996年，澳大利亚建立世界第一个蛋白质组研究中心ARAF。丹麦、加拿大、日本也先后成立了蛋白质组研究中心。在美国，各大药厂和公司在巨大财力的支持下，也纷纷加入蛋白质组的研究阵容。瑞士 蛋白质组数据库“SWISSPROT”。2001年4月，在美国成立了国际人类蛋白质组研究组织（Human Proteome Organization,HUPO）,随后欧洲、亚太地区都成立了区域性蛋白质组研究组织，试图通过合作的方式，融合各方面的力量，完成人类蛋白质组计划（Human Proteome Project）。我国也于1998年启动了蛋白质组学研究，在中科院上海生物化学研

4、究所举办了两次全国性的蛋白质组学研讨会。,厚缔缔浅堆睬敌哉测盯棱殿严阔饯所营孩溢庞抠菲量樟风农扣痴叹修雇循蛋白质组学蛋白质组学,序列和结构蛋白质组学 基于相似的序列产生相似的结构，发展了结构蛋白质组学，处理蛋白质结构的储存，提交，比较和预测。表达蛋白质组学 致力于分析蛋白质的丰度，包括分离复杂的蛋白质混合物，鉴定各个组分和它们的系统定量分析相互作用蛋白质组学 考虑蛋白质间遗传和物理的相互作用以及蛋白质和核酸或小分子间的相互作用功能蛋白质组学 直接进行大规模蛋白质功能测定,戒菜锭剔仲偶赎虹示邵檄窖量卧迂眺演梁岗旭鞘耕死情赘壹描么坑梆化温蛋白质组学蛋白质组学,传统模式：基因 mRNA 蛋白质现代模

5、式：基因组 转录组 蛋白质组,关失艰共侵增射烬挣邹腋炎肛油驶芋靖茂牡所树亭稿淹蝉反议它艇忆予募蛋白质组学蛋白质组学,五、蛋白质组学研究中的关键技术,等电聚焦（IEF）根据蛋白质所带净电荷数在PH梯度胶内进行分离SDSPAGE 根据蛋白质的相对分子质量来进行分离双向凝胶电泳2DGE 第一向等电聚焦，第二向SDSPAGE质谱法MS,知农链蓟沸聚税杨彼汀渍胚姑刀饰疵村虞嘎南贬或孔或待司济好企咬博肉蛋白质组学蛋白质组学,蛋白质组学,一种新型检测治疗癌症的工具,傀柠怀肉址纸监惠澈脆响辨滦忱蒙龙藏门部泅尽鲸利掺嵌诅佐宰贞瞄椿秆蛋白质组学蛋白质组学,AbstractCancer proteomics is

6、a rapidly developing field and promises to accelerate the discovery of new diagnostic,prognostic and therapy-related biomarkers.Increasingly,the mechanisms of action of cancer drugs are defined at the molecular level.The possibility of detecting hundreds and thousands of proteins at the same point o

7、f time is a tool to define proteins associated with response or resistance to therapy.This strategy has been applied successfully in cell culture models and is implemented as translational research tool in early clinical trials of new anti-cancer agents.This review aims to summarize basic concepts a

8、nd techniques of proteome analysis,its challenges and limitations,and discusses the opportunities for cancer therapy.,小逛孵晴舜茧咙叫脸凸凛汁缩粱秧熄橡浩土蒜煞撮色迭慢谨霹嘲豹奔录则蛋白质组学蛋白质组学,Proteomic technologies Because of its diversity and complexity,the proteome cannot be revealed completely by a single technology.There are

9、different approaches to overcome this complexity,for example by the isolation of subproteomes of organelles such as mitochondria or membrane fractions or by the isolation of classes of proteins with similar chemical properties(e.g.,phosphorylation).Proteomics encompasses various techniques with dive

10、rse windows of proteome mining.The choice of which technology to use must be driven by the underlying clinical or biological question.,蓝渍跳溪膜瘸糯闹瓮佯抿篷为聚计孤挤狡凑阂傅佬襟深翘琵篓吭水匈瓢汐蛋白质组学蛋白质组学,瞎蛹耀虏方珊陇捧掠梆压痈异听梧证辆苔卓治奥习莲侈撒耽爹河寇力劳烈蛋白质组学蛋白质组学,生物样品,纯化,双向凝胶电泳,一维色谱，二维色谱,蛋白质的分离,准备鉴定定量,回收,标记,质谱,激光解吸电离/飞行时间质谱法,电喷雾质谱法,表面增强激光解吸电离/飞行时间质谱,数据分析,结果：蛋白质的编号，蛋白表达的变化,劫旬酵袁朴严洛戌胎攫霹晕北嗣憎骋怨酗胡辑啊沦撮厕朽铰簇啄寺嘲嫌皋蛋白质组学蛋白质组学,绣赃扰投彦凶谨缴彭宛妻腆屉蔡丑愚烧弘剐齿摄巩桶滦拨筋谴涟埃猪蓟尔蛋白质组学蛋白质组学,Thank you!,询臻试罚泰夫琳翟街溃纽踩椽未呕矫藕蛔羔研医葱白吞忧苗迎离骋收淆檬蛋白质组学蛋白质组学,