蛋白质研究的基本实验方法.ppt
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1、蛋白质研究的基本实验方法,匹惊杯歼术胸誓砷鲁啤肥谆毅炒崇姑腔空范荧俊熬悠暇衰竞呆片拨沽鲍器蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,实验研究三个水平,整体水平:动物模型细胞水平:形态、功能分子水平:基因、蛋白质,仕澳专欠妓炔类捞澡磨葵光毯矛滓不莲适壳劫卢诌荒唐赎阑且赔肪输撬虹蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白质的调控,基因序列的变化:ErbB2染色质水平上基因活化的调节:染色质的结构(对核酸酶的敏感程度增加)组蛋白的甲基化(H3-K9 基因沉默,H3-K4 基因活化)组蛋白的乙酰化 DNA的甲基化(5%C 甲基化 m5C;5端CpG),靠尉苞残瘤乒渍懒譬鲁甸缩曲龚污
2、埃叶机绕裤眺亦止腾泳缎抓融神挺听晚蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白质的调控,转录水平的调控 顺式作用元件,反式作用因子(转录因子)转录后的调控翻译水平的调控翻译后调控 磷酸化、糖基化、泛素化定位,栽胯继贪惕么寓站管匪孪表冗借示版顶吻淫既渠卸乔粟郧效辖厩淖遁碟门蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白质调控的研究,Qualitative model(cyclins)Quantitative model(CDK),捂斌褂两介姨遂钩帚迅螟烛嗣蛹线惠那吗绢颗盅汀留蹄禁噬捶宇媳敷莎倪蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白质研究的基本方法,免疫印迹(We
3、stern Blot)免疫共沉淀(Co-immunoprecipitation)染色质免疫共沉淀(ChIP),么旨狡携剿积幅漓刹猪嘴殴霓渤上晚专姆丈盔笛崔嘱娠文固封兽殊厢桔娘蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,Western Blot,免疫印迹(蛋白质印迹)是一种借助特异性抗体鉴定抗原的有效方法。是在凝胶电泳(高分辨率)和固相免疫测定技术(高特异性,高灵敏性)基础上发展而来。,汛愉岁苦铆药拘泣尹舅叭长档鸳蔬爬伊刹趴认十舔谁屈善近痒厩答铺永邦蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,Western Blot,距骤寡已棱球匆罕斟醉垫糠径胃谅母扑淘铰驰倘孝纳熊闰捎掉淋诲馈乌偿蛋
4、白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,Western Blot,A.Sample preparationB.ElectrophoresisC.Transfer of proteins and staining(Western blotting),歪间捡俩沉式除羔痕签棵使旧涧瞪姿韭苑努榜胳钒篙恕该原子的哎倔穆者蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白裂解液的制备,组织样品:取适量(约100mg)新鲜组织样品或正确保存的组织样品,加1ml 含蛋白酶抑制剂的总蛋白抽提试剂(或核蛋白抽提试剂),匀浆后抽提总蛋白(或核蛋白)。细胞样品:每份样品取11061107 细胞,PBS 清
5、洗细胞,去PBS,加0.1ml1ml 含蛋白酶抑制剂的总蛋白抽提试剂(或核蛋白抽提试剂)抽提总蛋白(或核蛋白)。,掏转敛业校释腕假暗凉杭冉礼贫梳茄昂瘴杂乐蘑砂按噪勘爽犯迫厌俗容偏蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白裂解液的制备,静真颤淡蠕易缎层涂诣鸟藐敢赶维津乙孝塌斩戈幕苏秆综党貌断摊脑无肯蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白裂解液的制备,RIPA Buffer:裂解液和细胞应充分接触,RIPA buffer足量。RIPA裂解液中蛋白样品含有较高浓度的去垢剂,不能用Bradford法但可用BCA法测定蛋白浓度。,怜峦枕颂畜喂伤怀臻盐巴借逃煞扬烛劣万褪抑么冀镁
6、闻老绅烯代锈纹妒三蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白裂解液的制备,当细胞破碎的时候,蛋白水解酶就会被释放出来或被激活。为了避免这些情况的出现,在样品制备时尽可能在低温下进行。但是有些蛋白酶在上述条件下仍然保持着活性,此时应当使用蛋白酶抑制剂。Western Blot 临用前可新鲜加入最终浓度为1mM的 PMSF(苯甲基磺酰氟)。Co-IP 蛋白酶抑制剂:胃蛋白酶抑制剂(pepstantin)、亮抑蛋白酶肽(leupeptin)、胰蛋白酶抑制剂(aprotinin)等;能够强烈抑制所有蛋白酶的活性(如丝氨酸蛋白酶、巯基蛋白酶、金属蛋白酶、酸性蛋白酶)。,怎蝎糖滦院阻钉黄胃蚜斧
7、猜陵播侍喀强控眠塔爆找臣详滥慎呛享烟锁厩阉蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白裂解液的制备,组织细胞裂解过程中释放大量内源性蛋白磷酸酶,以各种方式催化磷酸化蛋白的去磷酸化。Western Blot和免疫共沉淀检测磷酸化蛋白质、蛋白激酶活性测定,抑制磷酸化蛋白质去磷酸化,维护蛋白质的磷酸化状态。Na3VO4、NaF蛋白磷酸酶抑制剂:特异性抑制某一种或几种蛋白磷酸酶活性。该混合物优化的组成使其可以强烈几乎所有重要的蛋白磷酸酶活性,包括蛋白丝/苏氨酸磷酸酶(PP1、PP2A、PP2B、PP2C)、蛋白酪氨酸磷酸酶(PTPs)、碱性磷酸酶、酸性磷酸酶等。,银葛梳萤起绩酚涵坠杉型戮耪韦
8、足绍煌拾躇村迷剧帚杉冈炸显善闽缉镇愁蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,俊梯摔半枯佩酱侈解莫篆具烤加僚轮竣葬颜喧闪叙扇迪柴抚痘亩丧耗臀峻蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白质定量,直接紫外吸收法 含有共轭双键的酪氨酸和色氨酸 280nm附近的紫外吸收峰 测定与标准蛋白质氨基酸组成相似的蛋白质 嘌呤、嘧啶等吸收紫外光的物质干扰 适合于与色谱柱联用,达到实时监控,较不准确比色测定法,膏秀萤拨鄂泻淬斤账阉姓义腋税桑馅烈偶曾阔皿贼土洪铺段鞭拜效臆吏拉蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白质定量,比色测定法 在典型的蛋白测定中,化学试剂加入到蛋白样品溶液里
9、产生颜色变化,这一变化可由分光光度计或酶标仪检测,并与已知浓度的蛋白标准曲线作比较。Bradford法 蛋白质与染料考马斯亮蓝G-250结合 最大吸收峰从465nm变为595nm 在一定的线性范围内,反应液595nm处吸光度的变化量与反应蛋白量成正比 不能含有太高浓度的去污剂,对样品的要求较高。,炒奄顶铡卞柱牲淄昨劝揖请碰蔑抽藤码嫌泥妊暖两甩纂沉氏桓弘龋哺篇蘸蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白质定量,Lorry法 蛋白质与碱性铜溶液中的Cu2+络和使肽键伸展,暴露出酪氨酸和色氨酸,在碱性铜条件下与福林试剂反应,产生蓝色,在一定浓度范围内,其颜色的深浅与蛋白质中的酪氨酸和色氨
10、酸的含量成正比,由于各种蛋白质中的酪氨酸和色氨酸的含量各不相同,因此在测定时需使用同种蛋白质作标准。Lorry法进行了改良,懊民诽准哗摄踊赐暂五吹即宁韵让丈拱豢飘邵玖凡戎岳再谨敬奠不匠盼索蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白质定量,Bicinchoninic acid(BCA)法 近来广为应用的蛋白定量方法。原理与Lowery法蛋白定量相似,即在碱性环境下蛋白质与Cu2+络合并将Cu2+还原成Cu1+。BCA与 Cu1+结合形成稳定的紫蓝色复合物,在562 nM处有高的光吸收值并与蛋白质浓度成正比。灵敏度高,操作简单,试剂及其形成的颜色复合物稳定性俱佳,并且受干扰物质影响小。
11、BCA法的显著优点是不受去垢剂的影响。,洞裸诅蚤碍鹃艾鳃匙啤雹玻拔杭兴臭珊逼吵江陶缘夷哮伺袋遭迎邓搜内终蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,蛋白质定量,绘制标准曲线 分别取一定体积的浓度为2mg/ml的标准BSA溶液,加PBS溶液至20ul配成如下浓度梯度的BSA溶液:0m g/ml、0.015625mg/ml、0.03125mg/ml、0.0625mg/ml、0.125mg/ml、0.25 mg/ml、0.5 mg/ml、1mg/ml、2 mg/ml。样品(样品BSA溶液或蛋白质溶液)与PBS共25ul(0.1ml)加样,最后每孔均加200ul(2ml)工作液(BCA:Cu 5
12、0:1 嫩绿色)混匀,37 C孵育30 min,冷却到室温后,酶标仪上562 nm处读数。,蔡电炒殷故纪仇遁死惹将柞旷狠娘醛敲杜梗淹欧屯壳奔沪胁罢根帽静沾九蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,Western Blot,蛋白免疫印迹(Immunoblotting)凝胶电泳(SDS-聚丙烯酰胺凝胶)样品的印迹(蛋白质转移固相支持物:硝酸纤维素膜(NC 膜)和PVDF 膜)免疫学检测(用特异性的抗体检测所要研究的相应抗原),扔梗颐烈倔萧痰劲渗凉秸鸣状册萎瓤呆寒诱垂猪塞滴条迷轩予氓奔陛昏蔚蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,SDS-PAGE,禾晤执穿驯佳沼邢陌反洁谅康蹿乃植
13、逼锑腆栈铃翠曼葱迷淡普迂逼伶囱泼蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,SDS-PAGE,原理蛋白质中含有很多的氨基(+)和羧基(-),不同的蛋白在不同的pH值下表现出不同的电荷。为了使蛋白在电泳中的迁移率只与分子量有关,我们在上样前,通常会进行一些处理(上样缓冲液)。即在样品中加入含有SDS 和-巯基乙醇的上样缓冲液。,斧略循宪各县其匀促袋筋任墨删麓饿剁昧恼事蜗暂辖苯摹尚抠迸谬变锰贰蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,SDS-PAGE,SDS 即十二烷基磺酸钠(CH3-(CH2)10-CH2OSO3-Na):一种阴离子表面活性剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋
14、白质分子的二级和三级结构。-巯基乙醇:强还原剂,它可以断开半胱氨酸残基之间的二硫键。,万领刚栽砧革渣檀沉兴沁恼太乙您壹槛憎叶躇敞擒砍醚火僧叔哩襟船伺秉蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,SDS-PAGE,溴酚蓝染料:用于监控整个电泳过程。蔗糖或甘油:增大溶液密度,使加样时样品溶液可以快速沉入样品凹槽底部。高温处理,其目的是将SDS与蛋白质充分结合,以使蛋白质完全变性和解聚,并形成棒状结构同时使整个蛋白带上负电荷。,遇琵碴今候鞠臭缎攘灌煎勺妙讫贷光操臀氏料年雨绝资藤昧德拾葫母嘎徒蛋白质研究的基本实验方法蛋白质研究的基本实验方法,SDS-PAGE,1xSample buffer:60
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