第01章蛋白质.ppt
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1、蛋白质的结构与功能,第 二 章,Structure and Function of Protein,一、什么是蛋白质?,蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。,二、蛋白质的生物学意义,1.蛋白质是生物体重要组成成分分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的45,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达80。,蛋白质占干重 人体中(中年人)人体 45%水55%细菌 50%80%蛋白质19%真菌 14%52%脂肪19%酵母菌 14%5
2、0%糖类1%白地菌 50%无机盐7%,1)作为生物催化剂(酶)2)代谢调节作用3)免疫保护作用4)物质的转运和存储5)运动与支持作用6)参与细胞间信息传递7)有机体的组成部分8)凝血,2.蛋白质具有重要的生物学功能,蛋白质是生命的 物质基础,三、蛋白质研究的意义,蛋白质技术是现在生物工程的热门技术:蛋白质表达分离纯化抗体特别是单克隆抗体的筛选研究蛋白质药物设计和生产氨基酸发酵营养保健品,蛋 白 质 的 分 子 组 成The Molecular Component of Protein,第 一 节,一、组成蛋白质的元素,主要有C、H、O、N和少量S。有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、
3、钴、钼,个别蛋白质还含有碘。,蛋白质的元素组成,碳 50氢 7氧 23氮 16%硫 03其它 微 量,各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16。,由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:,100克样品中蛋白质的含量=每克样品含氮克数 6.25100,16%,蛋白质元素组成的特点,凯氏定氮法,二、氨基酸 组成蛋白质的基本单位,存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,且均属 L-氨基酸(甘氨酸除外)。,(一)氨基酸的功能,作为寡肽、多肽和蛋白质的组成单位;作为多种生物活性物质的前体;作为神经递质;氧化分解
4、产生ATP;作为糖异生的前体;作为营养物质。,(二)氨基酸的结构通式,氨基酸是蛋白质水解的最终产物,是组成蛋白质的基本单位。从蛋白质水解物中分离出来的氨基酸有二十种,除脯氨酸和羟脯氨酸外,这些天然氨基酸在结构上的共同特点为:,(1).与羧基相邻的-碳原子上都有一个氨基,因而称为-氨基酸(2).除甘氨酸外,其它所有氨基酸分子中的-碳原子都为不对称碳原子,所以:A.氨基酸都具有旋光性。B.每一种氨基酸都具有D-型和L-型两种立体异构体。目前已知的天然蛋白质中氨基酸都为L-型。,(三)常见氨基酸的分类,中性AA(1)按R基团的酸碱性分 酸性AA 碱性AA 疏水性R基团AA(2)按R基团的电性质分 电
5、荷极性R基团的AA 带电荷R基团的AA,脂肪族A(3)按R基团的化学结构分 芳香族AA 杂环族AA,非极性氨基酸极性中性氨基酸酸性氨基酸碱性氨基酸,(四)氨基酸的分类,*20种氨基酸的英文名称、缩写符号及分类如下:,天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97,谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22,赖氨酸 lysine Lys K 9.74,精氨酸 arginine Arg R 10.76,组氨酸 histidine His H 7.59,1.酸性氨基酸,2.碱性氨基酸,甘氨酸 glycine Gly G 5.97,丙氨酸 alanine Ala A 6.00
6、,缬氨酸 valine Val V 5.96,亮氨酸 leucine Leu L 5.98,异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02,苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48,脯氨酸 proline Pro P 6.30,3.非极性疏水性氨基酸,色氨酸 tryptophan Trp W 5.89,丝氨酸 serine Ser S 5.68,酪氨酸 tyrosine Tyr Y 5.66,半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07,蛋氨酸 methionine Met M 5.74,天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41,谷氨酰胺 glutami
7、ne Gln Q 5.65,苏氨酸 threonine Thr T 5.60,4.极性中性氨基酸,几种特殊氨基酸,脯氨酸(亚氨基酸),半胱氨酸,胱氨酸,人体所需的八种必需氨基酸 赖氨酸(Lys)缬氨酸(Val)蛋氨酸(Met)色氨酸(Try)亮氨酸(Leu)异亮氨酸(Ile)苏氨酸(Thr)苯丙氨酸(Phe)婴儿时期所需:精氨酸(Arg)、组氨酸(His)早产儿所需:色氨酸(Try)、半胱氨酸(Cys),几种重要的不常见氨基酸在少数蛋白质中分离出一些不常见的氨基酸,通常称为不常见蛋白质氨基酸。这些氨基酸都是由相应的基本氨基酸衍生而来的。其中重要的有4-羟基脯氨酸、5-羟基赖氨酸、N-甲基赖氨酸
8、、和3,5-二碘酪氨酸等。这些不常见蛋白质氨基酸的结构如下:,(三)氨基酸的重要理化性质,1.一般物理性质,-氨基酸为无色晶体,熔点极高(一般在200以上)。有的无味、有的味甜、有的味苦、谷氨酸的单钠盐有鲜味(味精的主要成分)。,2.氨基酸的光学性质旋光性紫外吸收,紫外吸收,构成蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(220nm)均有光吸收。在近紫外区(220-300nm)只有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收光的能力。,大多数蛋白质含有这三种氨基酸残基,所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。,芳香族氨基酸的紫外吸收,3.两性解离及等电点,
9、氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于溶液的酸碱度。,等电点(isoelectric point,pI)在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。,pHpI,氨基酸的兼性离子,阴离子,阳离子,pHpI,应用:分离制备氨基酸,A.等电点时,氨基酸的溶解度最小,易沉淀。利用该性质可分离制备某些氨基酸。例如谷氨酸的生产,即将微生物发酵液的pH值调至3.22(谷氨酸的等电点)而使谷氨酸沉淀析出。B.利用各种氨基酸的等电点不同,可通过电泳法、离子交换法等在实验室或工业生产上进行混合氨基酸的分离或制备。氨基酸的等电点可由其分
10、子上解离基团的解离常数来确定。,(2)等电点理论的应用,(3)氨基酸等电点的计算,可见,氨基酸的pI值等于该氨基酸的两性离子两侧的基团pK值之和的二分之一。,氨基酸是离子化合物,但在溶液状态时,存在 下列平衡:,化学反应中可用左边的结构式表示氨基酸。,氨基酸分子的-氨基、-羧基均能参加反应,有的侧链R基团也能参加反应。,4、氨基酸氨基和羧基参与的化学反应,与亚硝酸的反应,在标准条件下测定生成的N2体积,即可计算出氨基酸的量。,用途:是范斯莱克(Van Slyke)法测定氨基氮的基础,可用于氨基酸定量和蛋白质水解程度的测定,室 温,(1)-氨基参加的反应,与甲醛的反应,用NaOH滴定,氨基酸甲醛
11、滴定法(概念),判断蛋白质水解或合成的进度,与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应 烃基化反应,2,4-二硝基苯氨基酸,黄色(DNP-氨基酸,可用乙酸乙酯或乙醚抽提),多肽或蛋白质N端氨基酸的-氨基也能与DNFB反应,生成DNP-多肽或DNP-蛋白质。后者用酸水解时,所有肽键被打开,可得到黄色的DNP-氨基酸。该反应由F.Sanger(英)首先发现,并用于鉴定多肽或蛋白质的N-端氨基酸,阐明了胰岛素的一级结构。(故DNFB亦称作Sanger试剂)蛋白质N端氨基酸测定的方法之一,5-二甲氨基萘磺酰氯(简称丹磺酰氯或DNS-Cl)代替DNFB试剂,5-二甲氨基萘磺酰氨基酸有强烈的荧光,可用荧光光度
12、计快速检出,灵敏度高。,酰化试剂,苯氨基硫甲酰氨基酸(PTC-氨基酸,无色),苯硫乙内酰脲氨基酸(PTH-氨基酸,无色,可用乙酸乙酯抽提),与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应烃基化反应,Edman(瑞典)首先使用该反应鉴定多肽或蛋白质的N-端氨基酸。蛋白质多肽链N端氨基酸的-氨基可与PITC反应生成 PTC-蛋白质,在酸性溶液中,它释放出未端的 PTH-氨基酸和比原来少了一个氨基酸残基的多肽链称为Edman降解反应。(故PITC亦称作Edman试剂)。该反应在多肽和蛋白质的氨基酸序列分析方面占有重要地位多肽顺序自动分析仪,一次可连续测出60个以上的氨基酸顺序。,(2)-羧基参加的反应,成盐和成酯
13、反应,该反应使氨基酸的氨基被活化,氨基酸与碱作用即生成盐。氨基酸的羧基被醇酯化,形成相应的酯。,脱羧基反应,蛋白质合成的氨基酸活化反应,(3)-氨基和-羧基参加的反应,与茚三酮的反应,茚三酮 水合茚三酮,+,水合茚三酮(无色),水合茚三酮,脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质,其余所有的-氨基酸与茚三酮反应均产生蓝紫色物质。,黄色,max=440nm,成肽反应缩合反应,这是多肽和蛋白质生物合成的基本反应,三、肽,肽键(peptide bond)是由一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合而形成的化学键。,(一)肽(peptide),蛋白质是由一条或多条多肽(polypeptide)
14、链以特殊方式结合而成的生物大分子。蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是将分子量在6000道尔顿以上的多肽称为蛋白质。蛋白质分子量变化范围很大,从大约6000到1000000道尔顿甚至更大,+,甘氨酰甘氨酸,肽键,*肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。,*两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨基酸缩合则形成三肽,*肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为氨基酸残基(residue)。,*由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连形成的肽称多肽(polypeptide)。,*主链和侧链,N 末端:多肽链中有自由氨基的一端C 末端:多肽链中有自由羧基的
15、一端,多肽链有两端,*多肽链(polypeptide chain)是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。,N末端,C末端,牛核糖核酸酶,(二)几种生物活性肽,1.谷胱甘肽(glutathione,GSH),GSH过氧化物酶,GSH还原酶,NADPH+H+,NADP+,体内许多激素属寡肽或多肽,神经肽(neuropeptide),2.多肽类激素及神经肽,+H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-COO-+H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-COO-Met-脑啡肽 Leu-脑啡肽,蛋白质的分子结构The Molecular Structure of Protein,第 二
16、 节,蛋白质的分子结构包括 一级结构(primary structure)二级结构(secondary structure)三级结构(tertiary structure)四级结构(quaternary structure),定义蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。,一、蛋白质的一级结构(Primary structure),主要的化学键肽键,有些蛋白质还包括二硫键。,一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。,一级结构的测定,(1)测定蛋白质的一级结构的要求A.样品必需纯(97%以上);B.知道蛋白质的分子量;C.知道蛋白质由几个亚基组成;D.测定蛋白质的氨基酸组成;并根据分子
17、量计算每种氨基酸的个数。E.测定水解液中的氨量,计算酰胺的含量。(2)测定步骤多肽链的拆分:测定蛋白质分子中多肽链的数目:二硫键的断裂:测定每条多肽链的氨基酸组成,并计算出氨基酸成分的分子比分析多肽链的N-末端和C-末端多肽链断裂成多个肽段测定每个肽段的氨基酸顺序。确定肽段在多肽链中的次序确定原多肽链中二硫键的位置:,二、蛋白质的二级结构,主要的化学键:氢键,(一)肽单元,参与肽键的6个原子C1、C、O、N、H、C2位于同一平面,称为肽平面。C1和C2在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元(peptide unit)。,(二)主链构象的分子模型,-
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- 01 蛋白质

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