第5章酶学.ppt
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1、第五章 酶化学(chemistry of enzyme),本章内容,第一节 酶学通论第二节 酶促反应动力学第三节 酶的作用机制和调节第四节 酶的应用(pp.319),要求,酶的化学性质、结构和功能;酶促反应动力学及酶的应用;与维生素的密切联系,了解VB族的生理功能;对调节酶、同工酶、诱导酶、多酶复合体、固定化酶等作较深入了解。,第一节 酶学通论,主要内容:一、酶促催化反应的特点二、酶的化学本质及组成三、酶的命名与分类四、酶活力的测定和分离纯化,酶学研究简史,公元两千多年前,中国就有酿酒记载。一百多年前,Pasteur提出发酵是酵母细胞生命活动的结果。1877年,Kuhne首次提出Enzyme的
2、名词。1897年,Buchner用酵母提取液(无活细胞),实现了发酵。1926年,Sumner首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。1982年,Cech首次发现RNA也具有酶的催化活性,提出核酶的概念。1995年,Jack研究室首先报道了具有DNA连接酶活性的 DNA片段,被称为脱氧核酶(deoxyribozyme)。,一、酶促反应的特征 pp.320,酶的概念 酶由活细胞产生的,对其特异底物具有高效催化作用的蛋白质(或核酸)。具有可调性和易变性特点。目前将生物催化剂分为两类蛋白酶、核酶(包括:RNA酶、DNA酶),1.酶与一般催化剂的共性,在反应前后没有质和量的变化(总的结果是不参与化学反应);只能催
3、化热力学允许的化学反应;只能加快反应速度,不改变平衡点。,pp.320,2.酶促反应的特点,酶促催化反应具有:pp.321(1)酶易失活(2)高效率(3)专一性(4)可调性,(1)酶促催化反应的高效率,酶催化的效率:pp.321通常比非催化反应高1081020倍,比一般催化剂高1071013倍;条件温和(37左右,pH接近中性);催化剂加速反应的机理:改变了反应历程,降低反应活化能。酶催化比非酶催化更有效地降低反应活化能。,活化能:底物分子从初态转变到活化态(过渡态)所需的能量。(如:A+BA-B)只有生成活化态分子才能发生反应。,体系总能量改变,非催化反应活化能,酶促反应活化能,自由能,反
4、应 过 程,反应物,产物,酶促反应活化能的变化图,(A+B),A-B,(C+D),一般催化剂催化反应的活化能,pp.320,过渡态,(2)酶促反应的专一性 pp.322,酶促催化反应具有高度专一性。这是与化学催化剂不同点。酶的专一性(specificity)指一种酶仅作用于一种或一类化合物,或一定的化学键,催化一定的化学反应,并生成一定的产物。,(3)酶促反应的可调节性 pp.322,与化学催化剂不同,酶促反应可受多种因素调节。调节酶浓度:诱导或抑制酶合成;调节酶降解。激素调节酶活性:通过细胞膜受体和细胞内受体反馈抑制调节酶活性抑制剂和激活剂调节酶活性其他调节方式:别构调节、酶原激活、酶的可逆
5、共价修饰等。,除上列调节方式外,还有下列因素可对酶调节酶催化反应速度。主要包括三方面:条件改变:T、pH、激活剂和抑制剂等变化;S改变:对初速度调节;E改变:E合成与分解的调节;,二、酶的化学本质及组成 pp.323,1.酶的化学本质:通常指蛋白质组成的酶类 蛋白质组成依据:酸、碱水解产物是氨基酸;能被蛋白水解酶催化分解;分子量较大,是具有空间结构的生物大分子,凡使蛋白质变性因素,均可使酶变性失活;具两性解离和等电点,可电泳分离;具胶体性质,不能通过半透膜;具蛋白质所具有的全部呈色反应。,2.酶的分子组成(可分为两类)pp.323,单纯蛋白酶:仅含有酶蛋白质部分。缀合蛋白酶(也称全酶)含两部分
6、:*只有在、共存时,全酶才具有活性。酶与辅助因子之间也是专一性结合。,辅助因子分类(按结合紧密程度)pp.324,辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤等方法除去。辅基(prosthetic group):与酶蛋白结合紧密,不能用透析或超滤等方法除去。,各部分在催化反应中的作用,一种辅助因子可与多种脱辅酶结合,而一种脱辅酶通常仅与一种专一性辅助因子结合。因此:酶蛋白(脱辅酶)决定了酶的结构,决定酶促反应专一性;辅助因子决定反应的种类与性质金属酶(metalloenzyme)金属为酶的活性所必需,与酶蛋白结合紧密,提取过程中不易丢失。金属激活酶(metal-activated
7、 enzyme)金属为酶的活性所必需,与酶蛋白结合不紧密,提取过程中易丢失。,金属离子的作用稳定酶的构象;传递电子,参与催化反应;在酶与底物之间起桥梁作用;中和阴离子,降低静电斥力等。小分子有机化合物的作用在反应中起运载体的作用,传递电子、质子或其它基团(H、-NH2、-CH3等)。,辅酶或辅基在催化中的作用 pp.325,3.酶的不同形式 pp.325,单体酶(monomeric enzyme)仅具有三级结构的酶,或只由一条肽链组成的酶。种类较少,多为水解酶类。寡聚酶(oligomeric enzyme)由两个或两个以上亚基(多为偶数)组成的酶。亚基间靠次级键结合,易分开。聚合型活性型;解聚
8、型非活性型。通常为调解酶,对代谢调控起重要作用酶。,多酶体系(多酶复合体)由几种不同功能的酶彼此嵌合,以非共价键连接形成的多酶复合体。其中一种酶催化反应的产物是另一种酶催化反应的底物。即多功能酶(串联酶)一些多酶体系在进化过程中由于基因的融合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中,形成多个结构域,这类酶称为多功能酶。,三、酶的命名与分类 pp.326 The Naming and Classification of Enzyme,(一)命名:1.习惯命名法命名原则:底物名称,有的加上来源;根据酶催化反应性质及类型命名。有的酶综合了上述两个原则此法简单,历史悠久,被广泛接受。但缺乏系统性,较混乱,
9、有一酶多名现象。,2.*国际系统命名法 pp.326原则:除水外所有底物名称均编入名称中,底物间用“:”隔开,加上反应性质。此法严谨,有系统性。消除了一酶多名的缺点。目前在教科书中、国际会议和论文发表等正式场合,均要求采用国际系统命名法。,(二)酶的分类及编号(ECn表示法),国际酶学会将所有的酶共分成六大类:pp.327 氧、转、水、裂、异、连(合)用1,2,3,4,5,6 表示1.氧化还原酶类(oxidoreductases,EC1)催化氧化还原反应。如:脱氢酶、氧化酶、过氧化物酶、加氧酶等;2.转移酶类(transferases,EC2)催化基团转移的反应。通常需要辅酶参加。底物(S)的
10、一部分与E或辅酶共价结合,之后转移给其他分子,如激酶等;,3.水解酶类(hydrolases,EC3)催化底物加水分解反应。如蛋白质水解酶 4.裂合酶类(lyases,EC4)催化底物移去一基团产生双键及其逆反应,因此也称合酶;5.异构酶类(isomerases,EC5)催化异构化,使底物分子内重新排列。是单底物,单产物反应。如变位酶,异构酶等。6.连接(合成)酶类(ligases,synthetases,EC6)催化两底物连接或结合的反应(耗能)。,亚类:pp.326根据底物中被作用的基团和键,每一类酶又被分为不同亚类,用1,2,3,4,编号;每一亚类又可分为亚亚类,用1,2,3,4,编号。
11、酶分类编号用4个数字表示,中间用“.”隔开,如:ECn.n.n.n 第一个数字表示6大类中之一;第二个数字表示某大类中某亚类;第三个数字表示某大类中某亚类中的某亚亚类;第四个数字表示该酶在其亚亚类中的排号。在编号前冠以EC。例如:EC1.1.1.1 醇:NAD+氧化还原酶;EC1.3.1.14,5-二氢尿嘧啶:NAD+氧化还原酶,一些酶的命名举例,根据酶对其底物选择的严格程度,专一性可分为两大类型:pp.3321)结构专一性绝对专一性;相对专一性;(族的专一性,键的专一性)2)立体专一性;旋光异构专一性几何异构专一性,四、酶促反应的专一性,1)结构专一性 绝对专一性:酶对底物要求非常严格,只作
12、用于特定结构的底物,进行一种专一性反应,生成特定结构的产物。如:尿酶作用于尿素,而对尿素衍生物不起作用,相对专一性 pp.332 作用于一类化合物或一类化学键包括:a.族(或基团)专一性:对底物靶键(专一性键)两端的基团要求不严格,仅对其中一端残基要求严格,而对另一端要求较宽松。如:-D-葡萄糖苷酶,仅要求葡萄糖以-D-葡萄糖苷键与另一基团R结合,而对R的要求不严格。,b.键的专一性:只针对底物中一定的键,而对键两端的基团无严格要求。如:酯酶催化酯键水解(如图),对R及R基团没有严格要求。,蛋白酶的专一性 pp.333,动物体消化道中蛋白酶种类很多,但专一性各不相同。如图:,氨肽酶,羧肽酶,胃
13、蛋白酶,胰蛋白酶,弹性蛋白酶,胰凝乳蛋白酶,举例:a绝对专一性:凝血酶:肽键的羧基端必需是 L-Arg 氨基端必需是 Gly,凝血酶水解位点,b相对专一性:蛋白酶水解肽键*胰蛋白酶:肽键羧基端必需是碱性氨基酸。Lys-CONH-CHR-Arg-CONH-CHR-胰凝乳蛋白酶:肽键的羧基端AA应是芳香族或非极性侧链AA RCH-CONH-CHR-胃蛋白酶:提供羧基的AA应是短链脂肪链氨基酸氨肽酶和羧肽酶 N端 NH2-AA1-AA2-AA3-AAn-2-AAn-1-AAn-COOH 氨肽酶 羧肽酶,3)立体专一性 作用于特殊的立体异构体,旋光异构专一性:如:L-氨基酸,D-氨基酸;-糖苷键,-糖
14、苷键等。几何异构专一性:如:顺式、反式异构体等,pp.333,4)关于酶专一性假说 pp.334,“锁钥学说”:酶与底物结构上呈锁与钥匙的互补关系。如图:,局限性:活性中心的刚性结构不能解释酶催化可逆反应的原理。,“诱导契合假说”pp.334,酶与底物相互接近时,酶结构被诱导、变形,使相互适应,进而相互结合。这一过程称为酶-底物结合的诱导契合学说,需形成E-S复合物(中间过渡态)。,S存在时,E活性中心构象发生变化,以适应与底物结合诱导契合 pp.335,羧肽酶的诱导契合模式,五、酶的活力测定和分离纯化 pp.335,1.酶活力的测定酶活力指酶催化反应的能力 用酶促反应速度(v)表示酶促反应速
15、度在适宜的反应条件下,单位时间内底物的消耗量或产物的生成量。,酶的活力单位(U)pp.336,衡量酶活力大小的尺度,即在规定条件下,酶促反应在单位时间内(s、min或hr)生成一定量(mg、g、mol)的产物或消耗一定量底物所需的酶量。用U来表示。酶含量可用:U/g;U/ml,*酶的国际单位(IU)pp.336在最适条件下(25),每分钟催化1mol底物转化为产物所需的酶量为一个酶国际单位。1IU=1mol底物/min=10-6 mol底物/60s,催量单位(katal)催量(kat)指在特定条件下,每秒钟使mol底物转化为产物所需的酶量。1kat=1mol底物/s,kat与IU的换算:1IU
16、=16.6710-9 kat1 kat=1mols-1=6107IU,酶的比活力 pp.336 指单位质量(mg)蛋白质中所含的酶活力单位(U/mg)。比活力=酶活力单位/mg Pr=总活力IU/总Pr mg 代表酶的纯度,酶活力的测定方法 pp.336,酶活力的测定是测定产物的生成量或底物的减少量。具体方法可以有:分光光度法;荧光法;同位素测定法;电化学方法,2.酶的分离和纯化 pp.337,蛋白酶分子中以蛋白质为主,易受很多因素影响。其分离与纯化遵循蛋白质分离原则。凡影响蛋白质活性的因素均影响酶促反应速度,影响酶活性,在分离提取过程中应尽量回避。,酶提纯的目的:a.保持高活性;b.浓缩;c
17、.除杂质衡量提纯方法优劣的两个指标:总活力的回收率:说明提纯中酶损失情况 比活力提高倍数:说明某提纯步骤纯化程度 计算方法:,好的方法应该上列二者兼顾,但通常难以做到。因此,需根据需要综合选择。,酶分离纯化应注意:pp.3381)选材:新鲜、酶丰富;2)破碎:动物细胞(研磨、匀浆)、微生物及植物细胞(因有细胞壁,应采用超声波、细胞磨、冻融、溶菌酶等方法);3)抽提:低温下,用水或低盐溶液浸提;4)分离纯化:注意酶活性,条件温和,避免强酸、强碱和剧烈搅拌、在04下进行;5)加入少量保护剂:如:EDTA(金属螯合剂)、-巯基乙醇(-SH保护剂)等;6)分析各步分离效果:每步均检测酶活力和比活力,以
18、了解该步的回收率和纯化倍数;7)浓缩:结晶或冻干。高纯度酶液应制成结晶或冻干品,易保存;8)保存:-20-70,第二节酶促反应动力学,Kinetics of Enzyme-Catalyzed Reaction pp.351,涉及内容,一、化学动力学基础二、底物浓度S对酶促反应速度的影响三、抑制剂(I)对反应速度的影响四、酶浓度E对酶促反应速度的影响五、温度(T)对酶促反应速度的影响六、pH对酶促反应速度的影响七、激活剂(A)对酶促反应速度的影响,一、化学动力学基础,概念 pp.351酶促反应动力学研究各种因素对酶促反应速度的影响,并加以定量的理论。影响因素包括酶浓度(E)、底物浓度(S)、酸碱
19、度(pH)、温度(T)、抑制剂(I)、激活剂(A)等。研究一种因素的影响时,其余各因素应保持恒定。,二、底物浓度对反应速度的影响,1.单底物、单产物反应体系2.用单位时间内底物的消耗量和产物的生成量来表示(反应速度);3.反应速度取决于初速度,即底物的消耗量很小时(一般在5以内)的反应速度;4.设:SE,研究前提,酶促反应速度曲线,斜率产物/时间v,线性部分属于初速度范围,当S较低时,v S;一级反应,在其他因素不变的情况下,底物浓度对反应速度的影响呈矩形双曲线关系。,E-S含量极少,随着S,v 不再呈正比例加速(变缓慢),混合级反应。,v,S,Vmax,E-S含量较多,当S 达到一定程度时,
20、几乎所有的酶均已与底物结合,随着S 的增加,v 几乎不再增加,接近最大速度Vmax,零级反应。,E几乎全变成E-S,(一)米曼氏方程式*,描述 Sv 关系的方程 pp.356酶促反应模式中间产物学说,1913年Michaelis和Menten提出:反应速度与底物浓度关系的数学方程式,被称为米曼氏方程式,简称米氏方程(Michaelis equation)。,S:底物浓度 v:反应速度 Vmax:最大反应速度(maximum velocity)m:米氏常数(Michaelis constant),v,米曼氏方程式推导的两个假设:假设1:E与S形成E-S复合物的反应是快速平衡反应;E-S分解为P及
21、E的反应为慢反应,反应总速度取决于慢反应。即方程式:v k2E-S(1)假设2:S总浓度 E总浓度,则在反应的初始阶段,S可认为不变即 SSt St:反应中 S总,推导过程,稳态:pp.356-357 是指E-S的生成速度与分解速度相等,即E-S恒定。,Km的定义和推导,Km反应速度达到最大反应速度一半时的S。单位为浓度单位,如:mol/L。,推导:,(二)Km与Vmax的意义,Km值 pp.359-361 Km等于酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度。意义:Km代表整个反应 v 与 S 的关系;Km是酶重要的物理常数,可通过Km鉴定酶。受S、pH、T、离子强度影响;,Km可近似表示酶对
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