最新中国前列腺癌患者基因检测专家共识.docx

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1、最新中国前列腺癌患者基因检测专家共识摘要随着第二代测序(next-generationsequencing,NGS)技术在前列腺癌诊疗中愈加广泛的应用，越来越多的患者能够从前列腺癌精准治疗中获益。美国食品药品管理局(FoodandDrugAdministration,FDA)已批准多聚腺昔二磷酸核糖聚合酶Lpoly(ADP-ribose)polymerase,PARP抑制剂用于携带同源重组修复基因突变的转移性去势抵抗性前列腺癌的治疗；而就程序性死亡蛋白-1(programmeddeathl,PD-I)/程序性死亡蛋白配体-1(programmeddeathIigand-I,PD-LD抗体等免疫

2、检查点抑制剂而言，错配修复缺陷及高微卫星不稳定型前列腺癌患者能够通过帕博利珠单抗(PembrOIiZUmab)治疗获益。此外，NGS检测对于携带胚系基因突变患者家属肿瘤发病风险的预估也具有重要作用。如何在利用NGS技术精准定位可获益前列腺癌患者的同时避免过度检测，如何在遗传咨询中针对基因突变进行解读并提供后续的诊疗建议，从而为中国前列腺癌患者制定个体化的治疗方案是所有临床医师面临的重要问题。在中国前列腺癌患者基因检测专家共识(2018年版)和中国前列腺癌患者基因检测专家共识(2019年版)的基础上，中国抗癌协会泌尿男生殖系肿瘤专业委员会及中国临床肿瘤学会前列腺癌专家委员会组织专家结合最新发表的

3、数据形成中国前列腺癌患者基因检测专家共识(2020年版)(以下简称中的规范应用，不断优化患者的个体化诊疗方案，探索并建立以肿瘤生物标志物为引导的临床治疗路径。-Ze-1-1前S随着第二代测序（next-generationsequencing,NGS）技术在包括前列腺癌等肿瘤临床诊疗中得到愈发广泛的应用，对NGS在前列腺癌临床应用过程中的检测内容、检测技术、生物信息学分析、数据处理及解读等环节的质量管理提出了更高的要求。国外已出台了诸如基因检测对遗传性前列腺癌风险评估作用：2017年费城前列腺癌会议共识1（以下简称费城共识）等共识以规范该技术在前列腺癌患者诊疗及筛查中的应用；中国抗癌协会泌尿男

4、生殖系肿瘤专业委员会也相继出版了中国前列腺癌患者基因检测专家共识（2018年版）和中国前列腺癌患者基因检测专家共识（2019年版）。中国前列腺癌患者基因检测专家共识（2020年版）（以下简称2020年版共识）在综合国内外最新指南共识的基础上，参考最新发表的前列腺癌精准治疗相关研究数据和文献，进一步规范和指导前列腺癌基因检测的对象、内容、技术、数据处理和解读。推荐有意愿进行基因检测的受检者以指导治疗决策或以遗传咨询为目的进行基因检测。随着中国前列腺癌患者基因突变特征及精准治疗数据的不断产出，未来将继续结合中国前列腺癌患者的精准诊疗数据更新本共识;同时继续呼吁建立医院、基因检测实验室（公司）等相关

5、机构共同参与的协作数据共享平台或数据库，以明确中国前列腺癌患者的驱动基因突变分子特征及其与转移、复发、疗效评估、药物不良反应的相关性等信息。2020年版共识专家委员会也倡导各单位组建生殖泌尿肿瘤精准医学专家团队（genitourinarymoleculartumorboard,GU-MTB）,为肿瘤治疗提供更多选项，优化患者的个体化诊疗方案，并建立生物标志物引导的临床治疗路径。2适宜进行基因检测的对象不同病情和治疗阶段的前列腺癌患者的基因突变特征各异R,基于前列腺癌临床实践及药物研发现状，推荐基于“提供遗传咨询”和“制定治疗决策”为目的的NGS基因突变检测（表1）。1适宜进行薨因检测的前列静通

6、患者冷测日的仁渊人耶提供遗传咨询Jl厅明确家收史的j诊一进行风险if席戒械抵至中凤即列毓耶思；家族史不讦或不明礴患者禽经肿斓遗传咨训指导后除合号虑检测必要性Al,极高风险前列踪塌患石一部进照NI）或转移性（M1）前列WMft患#.!前列腺/竹内第（intraductalcarcinomaoftheprostate.IDC-P）或W列腺#竹脓麻（ductaladenocarcinomaoftheProMate.DAP）病理学特征的前列腺施Ml肿微组饮检测Ll发现。肿瑞发限以启相关网困突交而缺乏胚系变异依证的前列腺麻患井.进行遗心咨询推柞后再学忠检渤制定治疗决策M移性去势抵抗性前列腺钠标介班而网络

7、（NalgnidComprehen-VeCancerNetwork.NCCN）附舛3幅标麻实践指南（2O2OV2）（以卜勖称NCCN指南）提供遗传咨询：评估是否适宜进行基因检测需要结合前列腺癌患者的家族史、临床及病理学特征。其中家族史需要考虑：是否有兄弟、父亲或其他家族成员在60岁前诊断为前列腺癌或因前列腺癌死亡；是否在同系家属中具有3名及以上包括胆管癌、乳腺癌、胰腺癌、前列腺癌、卵巢癌、结直肠癌、子宫内膜癌、胃癌、肾癌、黑色素瘤、小肠癌及尿路上皮癌的患者，特别是其确诊年龄W50岁；患者个人是否有男性乳腺癌或胰腺癌病史；是否已知家族携带相关胚系致病基因突变。NCCN指南显示，夕宛如/2基因有害

8、突变的携带者在65岁之前罹患前列腺癌的风险增加，特别是BRCA2胚系突变患者有更高BRCA/2胚系突变的携带者从40岁起每年行基于前列腺特异性抗原（prostate-specificantigen,PSA）的前列腺癌筛查。对于初诊未进行风险评估、极低风险至中风险的前列腺癌患者，其家族史的获得及遗传咨询是检测前的必要步骤：对于具有明确相关家族史、已知家族成员携带胚系致病基因突变的上述风险级别患者，推荐进行DNA损伤修复相关基因（特别是BRCA2、BRCA.ATM、PALBl.CHEIa、MLHi、MSm、MS册、PMSI）的胚系变异检测；对于家族史不详的上述风险级别患者，需要结合临床特征进行遗传

9、咨询后综合判断是否有必要进行相关检测。对于高风险、极高风险、局部进展及转移性前列腺癌患者，推荐进行DNA修复基因（特别是身匕42、BRCA.ATMPALB1、CHEfa、MLH、MS他、MS册、PMS2）的胚系变异检测。另外，IDC-P和DAP是前列腺癌中具有独特病理学特征的亚型。DAP发生率较低，仅占全部前列腺癌患者的现；而IDOP在不同的样本类型、风险及临床分期前列腺癌患者中所占比例不同：在低风险、中风险、高风险及转移复发前列腺癌中，IDC-P的比例分别为2.1乐23.1%.36.7%及56.0%。与腺癌患者相比，IDC-P和DAP患者基因组不稳定性、错配修复基因及同源重组修复（homol

10、ogousrecombinationrepair,HRR）基因（特别是BRCA2基因突变）比例更高皿】。IDC-P和DAP患者预后较差，对具有该病理学特征的前列腺癌患者，不论是否存在明确的肿瘤家族史均推荐进行胚系基因检测。制定治疗决策：对于所有mCRPC患者，推荐进行至少包含HRR基因胚系及体系变异的检测，并可以考虑行微卫星不稳定性(microsatelliteinstability,MSI)和DNA错配修复缺陷(DNAmismatchrepairdeficiency,dMMR)检测。如肿瘤组织检测已发现与肿瘤发病风险相关基因突变而缺乏胚系变异验证的前列腺癌患者，建议遗传咨询后再考虑是否进行检

11、测。3检测内容虽然通过NGS技术发现多数mCRPC患者存在具有临床价值的基因突变，但是由于药物研发及相关药物在前列腺癌患者临床研究中的证据有限，针对前列腺癌患者的NGS基因检测应在增加受检者获益及避免过度检测中求得平衡。二代测序技术在肿瘤精准医学诊断中的应用专家共识间建议检测应包含国际、国内指南中明确指定、美国食品药品管理局(FoodandDrugAdministration,FDA)/中国国家药品监督管理局(NationaIMedicalProductsAdministration,NMPA)批准的适应证相关的临床分型基因突变，还应纳入正在开展的任何期别(IIII期)临床试验中的药物相关靶点

12、、已完成或即将开展的临床试验的入组标准中药物相关靶点及其他癌种指南中推荐的药物相关靶点。有限基因数量的组合则可能导致治疗、遗传相关基因突变信息遗漏并增加受试者后续检测费用及样本损耗。因此2020年版共识建议针对不同遗传背景及检测目的的受检者，应根据实际需要进行检测组合的筛选，检测组合和检测流程应在临床应用前进行充分的性能分析评估。其中，国际指南、共识及大型临床研究均发现HRR基因突变前列腺癌患者对奥拉帕利(Olaparib)等多聚腺甘二磷酸核糖聚合酶Lpoly(ADP-ribose)polymerase,PARP抑制剂敏感；CNCCN指南推荐HRR基因突变的CRPC患者接受OIaParib治疗

13、(1类推荐)，推荐卢卡帕尼(rucaparib)作为BRCA突变的CRPC的治疗方案(2A类推荐)；同时美国FDA已批准OlaParib用于治疗经新型内分泌治疗后进展且携带HRR突变的mCRPC患者(ATM、BRCA.BRC加、BARD、BRIA、CD八2、CHEKi、CHEK1、FANCL.PALB1、RA%B、RA为C、RAIDD、RA侬L),批准rucaparib治疗经新型内分泌治疗和多西他赛化疗后进展且携带BRCA突变的InCRPC患者。此外，目前受到广泛关注的免疫检查点抑制剂如程序性死亡蛋白T(programmeddeath-l,PDT)/程序性死亡蛋白配体T(programmedd

14、eathIigand-I,PD-L1)抗体在未经筛选的前列腺癌患者中受益较为有限；NCCN指南建议通过检测错配修复及MSI筛选出的dMMR及高微卫星不稳定(microsatelliteinstability-high,MSI-H)型前列腺癌患者再考虑帕博利珠单抗(PenIbroliZUmab)治疗(表23)。我但布佐香。MC2 BC.4l ATU iUl2 CHK2 XtLHl USH2 MSHb P.VS2( CDKll*I JtSMP BUPl .r.gJixnu 4M4. FCU/lM便的决电 MCA2. BRCn ATU PALK FAXCL HSB RlDMC AWSID. WUPI

15、 MWI CWEJCI Cn CDK12. AWMZKMDNAnMVW Mnr AIV AOflU . WiCA Msm 1M6 G.M /UP5I. Eun 处.PCU/ tTP2KLl HXUCZ I布商511* KV46&CV3 . H .Ot g M 7,CDKNyB CDKN2.4 CDKX2S CCXDl PIKKA PJKKB x3i. An n. fun 鸣惊)e向司，tn或Mlt舅FC iJWW*fc eBMMl 连VUM放*金，4,SlM /4、押”史.BiAG和；*M/怜册比九 I WHW1etKhf “；9thW及9管AK p.Mfpc f*u LmIkWa N帝 I

16、城 MiMH夬食：4W *4i/家属史.经允分件济 W供1；修衣；”9M税的用或腐 I itMlMrtHUtKiKjf 0 3： 9管内0UTHU: AK 龄及nI“您RtIG IMtffK 4ra*rCMCCKFCCRK-CWM专体忖k 、圾付:5ia-r“条体系环系体系:-PC-fc:圣ISHX2M,“t*I、样外同行笈检检阳的恰M；科累体4MZMItWHI-1ICHoMttdZUHMtHKIiiri9hVfUH1Wltf,s5trl兄由，IREN*或N触*塾应MAWWel口*fll*K*UU表3前列牌离基因检测的必要性等级判定说明导级检濡必要性等级判定说明该期因突变作为美EFDR中WNM

17、PA批4J他列腺膈治疗方法的取出或耐药的，I物标志物经的例朦像,业指南.共识（如ENCCN指用费城共识）可定.变是特定治疗方/在前划腺媚中的敏人或耐药的土物标忐物.具有明确检测意义.Il该基内突变或旷增件前列腺箱中具有定的发生率经前列腺密C业指南.强识（如NCCN指南费城共识判定在特定麻种中的俺后小物标志物B”高质麻临床研究证实H仃该他域C家认可.检制该珏因突变是治疗方法作前列腺麻中的敏盛或耐外的小物标志物”，、业指雨如NCCNftiiIi）:灿UtiH排M该M闪突变是治疗方法在前夕爆睇中的收夔或耐药的卜物标忐物.具G明确的检测意义.但该基因突变在前列腺麻患并中发生率较低经高旗用临床研究i三寞

18、,该从闪突变是治疗方法在前列麻幅中的债用牛物标志物C该林因突变作为美IHFDA/中INNMPA批布治疗方法成4业协会判定该从内是特定治疗方法作其他粗WIl前列脓幅）中的域感或耐药的生物标芯物基因突变是临床试验的纳入或排除标格的生物标志物：行与该基因出关的记向药物在前列朦皑中开展幅床试验（不论期别）较高质JR临床研究发现的具“电床意义的底因突变.但与特定治疗法的HI关性仃心进步证实D机厂料例报道.临床前研究,生物学功能及少员样本的研究,该赭因突变8小对泄住治疗方法做感或耐药.或对前列腺麻患W债后产生影响该甚囚无潜作品向治疗方法或行无与该彩内和大把向治疗在前列腺媪中开展的临床试妗（不论期别）*：前

19、列腺麻桩囚检清的必要性等级判定应结合临旅指4性原则及从因突变的发生率3.1NGS检测的样本类型根据检测目的需要区分胚系（germline,来源于父母生殖细胞的变异，可通过生殖细胞继续遗传给子代）或体系（somatic,机体细胞后天产生的基因变异）变异检测。其中使用受试者的血液（优先考虑）、唾液、口腔拭子等样本可进行胚系变异检测；而受试者肿瘤组织（如新鲜肿瘤组织、石蜡包埋组织切片等）或循环肿瘤DNA（circulatingtumorDNA,ctDNA）则可进行胚系+体系变异检测，在肿瘤组织或CtDNA检测的基础上，必要时需要进行胚系基因变异验证（或同时进行胚系基因变异检测）。由于前列腺癌中体系突

20、变的存在（尤其是HRR基因），单纯的胚系突变检测不足以反映肿瘤实际的基因突变状态。CtDNA来自于肿瘤细胞剥落的片段DNA释放入血液中，通过无创获取血液样本可以实现动态监测肿瘤变化，因此也越来越广泛地应用于临床实践中。CtDNA检测灵敏度和特异度受限于血浆中的CtDNA的基因突变丰度，一项纳入45例mCRPC患者的研究11显示，CtDNA的基因突变丰度2%不能准确地进行突变检测，基因突变丰度35%不能计算基因拷贝数变异,基因突变丰度，35%时与组织样本检测一致性可达到90%以上。局限期前列腺癌肿瘤负荷较小，血浆中CtDNA的基因突变丰度较低，低于检测阈值，液体活检不能发现临床有意义的突变口2,

21、在一项纳入53例新诊断转移性激素敏感性前列腺癌患者的研究，3中，在平均测序深度927X的条件下，血浆CtDNA的基因突变丰度均值为11%,液体活检与组织检测一致性为80%；在短期（22d）雄激素剥夺治疗（androgendeprivationtherapy,ADT）后，CtDNA的基因突变丰度下降至1%左右。在CRPC患者中，70%以上患者CtDNA的基因突变丰度2%,与组织检测一致性达到90对。目前组织检测仍是基因检测的金标准，在组织检测失败或组织不可及的情况下，可以考虑使用CtDNA的检测方式，两者之间的一致性还需要进一步的研究探索和数据支持。3.2NGS检测的基因3. 2.1BRCMBR

22、CAl及ATM一项对2019例受试者的研究15发现，携带胚系BRCAl/2基因突变与更具侵袭性、更高概率的淋巴结、远端转移发生及更短的生存时间相关。TOPARP-A、TRlToN2及TOPARP-B等多项大型II期临床研究1回均发现，具有DNA修复（特别是BRC4/2）基因体细胞或胚系变异型mCRPC患者可能对PARP抑制剂敏感。In期临床研究PROfoundc193明确证实具有HRR基因突变的患者（特别是BRCAX/2和ATM）,能够从Olaparib单药治疗中获益，其中BRCAX/2和力/突变患者能够降低66%的影像学进展或死亡风险（表4）。同时有限的证据显示，携带该分子特征的前列腺癌患者

23、可能对伯类药物化疗敏感。最近的研究口口对2792例mCPRC患者行肿瘤组织NGS检测发现，27.9%的患者存在HRR基因突变，其中携带以02基因突变的患者比例为8.7随携带力加基因突变的患者比例为5.9乐携带HOn基因突变的患者比例为1.0%；中国前列腺癌患者携带BRCAI/2及力7基因突变比例的研究数据较为匮乏，2019年发表的一项纳入316例中国前列腺癌患者的研究显示，通过胚系基因检测，6.33%的受试者携带用匕42,0.63%的受试者携带打。1,0.63%的受试者携带力加基因致病变异。而在转移性激素敏感性前列腺癌阶段，一项纳入139例患者的研究显示，28例患者(20.1%)携带胚系DNA

24、损伤修复相关基因突变，突变患者会在更短时间内进展至mCRPC(8.3个月PS13.2个月，HR=2.73,70.001),特别是BRCA2突变患者中位至InCRPC时间仅为6.3个月。4PARP到M剂及铀类药物对前列腺癌息冬的疗效评估ItAttWHl美殳试片Mtt疗效W(价生芍文献HRRK因突变PmCRPC387研究雄人外领N内分泌治疗进展的mCRPCft.比较接受。即nb治疗和反触选的另忡孰W内分氾治疗的1，茯&K中揖带WfClJ4DUIU5：患存的两组同况像学无遗收工存期分别为7.4H3.6个“HR=OM.9SCI：025-047.P-OOOl；携语所“15个HRRM闪突变愚希的IumI阿

25、影像7Jt进展生期分别为5*W35个S49.95*.C1:0.38963.OOOI)191DNAWVM因夬变叩IUCRpC16接Nogmb治疗.14例*片驹hi女治疗.tMO.我中包括4伸揖帝体细布变V.3网携带8AC2MW朴系变立2阿4小从因朴系变W避例体涮也变V:(fDNAttV%Uk变的试不中位比像学无期为9.8个月.中位肥牛存期为13界个月16DNAUttl4lWrnCRPC98RtoIaperibiiJfr.擅带8KC4L2M因突变患赤的响应+：为80.S(24/30).中位JLii三1fNII为8I个/1：携带.41因突左患彳的响应中为36.(7/19中KtJIiasM为6.1个月

26、117)DNA修UME突变PmCRPC8SI/今napanb治疗.25例挟带BW2族囚突变生并ftT#F视啊G华为440.疾病护M率为皿0*：S伺机带因突变患并A出现客屹50.崔带生中博TH(2*133)-12冏内出BePSA卜芹50%P213.2.2其他HRR相关基因在转移性、高风险和中低风险前列腺癌患者中携带胚系DNA修复基因突变的比例为11.8%、6.0%W2.0%24；除上述的功7C41/2及力力基因外，在转移性前列腺癌患者中还检出CHEKl.RAD5DATR、NBN、GENl.MREiXA.翻7I及J1754等DNA修复基因胚系变异。中国316例前列腺癌患者中除以。1/2、月以外，还

27、检出2例GEe263%)、1例CHEKl(0.32%)及1例FANCA(0.32%)基因胚系致病变异，提示中国转移性前列腺癌患者胚系基因突变谱与国外人群存在差异22o导致DNA修复缺陷的相关基因的胚系变异和体细胞变异，均是伯类药物和PARP抑制剂的增敏性潜在生物标志物，但由于携带该基因突变前列腺癌患者比例较低且临床入组人数有限，因此上述基因及具体变异与钳类药物和PARP抑制剂疗效的相关性有待进一步临床验证口咒约12.9%的东亚mCRPC患者和4.2%的非东亚mCRPC患者可能携带CDK2基因突变/缺失，物12缺失与基因组不稳定性及免疫原性相关，携带该分子特征的患者可能对PARP抑制剂17-19

28、及免疫检查点抑制剂敏感25o-项大型W期临床研究显示，在InCRPC的肿瘤组织中，BARD1、BRIPI、CDla2、CHEKl.CHEI2、FANCL.PALB2、RAD5B、RA3C、阳历1和RA为4L等HRR基因的突变比例总和约为12.3%,并且携带这些基因突变的患者对PARP抑制剂的治疗敏感。3.2.3错配修复基因回顾性研究图6发现，错配修复基因突变型前列腺癌患者的临床和病理学特征更具侵袭性。国外研究271报道，前列腺癌患者中dMMR及MSI-H患者比例为2%5虬另有研究报道，约3%的前列腺癌患者携带,岭必(2%)、(1%)、MS质(1%)及PMS2(1%)基因体细胞变异，携带上述基因

29、突变的患者往往具有最高的总体基因突变数量。在中国316例前列腺癌患者中，携带.50%.中位无选展生。期为9个”:3例患%出现彰像学客酰软组织响应263.2.4其他基因有研究报道，在家族性前列腺癌患者中发现HoXBvi基因突变（主要为G84E）；但是基于中国前列腺癌遗传学联合会前列腺癌的研究数据，在671例受检者中仅有3例携带HOXBV3基因突变（片0.027）,且突变为G135E而非高加索人中的G84E热点。HoXBVi基因的检测并无明确的治疗指导作用，但对直系家属具有肿瘤风险评估价值。费城共识提出需要对与遗传性前列腺癌相关的。M3基因进行检测（共识率95%）,但鉴于其在中国患者中的发生率及靶

30、向治疗相关性，2020年版共识建议综合受检者前列腺癌家族史考虑HoXBvi基因突变的检测意义。除HRR基因及DNA错配修复通路相关基因外，研究发现前列腺癌患者中还会出现包括AR、%53、磷脂酰肌醇3-激酶（phosphatidylinositol3-kinase,PI3K）/蛋白激酶B（proteinkinaseB,AKT）信号转导通路QPTEN、PIKiCA.PIKiR.AKT.AKTi等）、WNT信号转导通路（APaCTNNB1、等）、细胞周期通路（砌、CCND1、CDKNAB.CDKNYB.CDK4等）、丝裂原活化蛋白激酶（mitogen-activatedproteinkinase,M

31、APK）信号转导通路（BRAF、HRAS.KRAS等）以及染色体重塑（KM72A、KMTiaKMTZD.KD胧A等）等基因突变。针对以上通路的靶向药物如AKT抑制剂，显示出在晚期前列腺癌的抗肿瘤活性，Ib期研究34显示能够降低25%的影像学进展或死亡风险。但目前临床应用证据仍比较有限，对上述基因突变检测的意义仍有待进一步确认，同时鼓励具有相关基因突变的前列腺癌患者积极参与药物临床研究。近期多项研究加发现，RBl基因突变或缺失对mCRPC患者具有重要的预后预测价值，在mCRPC中，能1基因突变或缺失与更差的生存期及阿比特龙或恩杂鲁胺更短的治疗时间有关，。另外，力万基因扩增/配体结构域变异及外3基

32、因突变也与前列腺癌阿比特龙及恩杂鲁胺敏感性降低相关FOXAX是与AR受体通路相关的重要基因，FOXAX高表达与前列腺癌的不良预后相关。最近的一项对208例局限期前列腺癌患者的研究发现，41%的中国患者携带RZMl突变，远高于既往西方发达国家患者的比例。并且中国患者FOXAX突变绝大部分为热点突变，可能通过调节AR通路促进前列腺癌的发生、发展。4、NGS检测流程的规范基于NGS技术的基因检测流程可以分为6个环节，即样本获取及处理、核酸抽提、文库构建、上机测序、数据分析、变异解读及临床检测报告出具。每个环节都包括相应的质控步骤，以下结合前列腺癌特点简要介绍各环节重点，详情请参照临床分子病理实验室二

33、代基因测序检测专家共识c38二代测序技术在肿瘤精准医学诊断中的应用专家共识c0基于下一代测序技术的BRCA基因检测流程中国专家共识如等共识要求。样本获取及处理：胚系突变检测一般使用血液、唾液、口腔拭子等样本，目前以血液为主。肿瘤检测一般使用手术或穿刺获得的肿瘤样本。由于前列腺癌病程较长，手术存档标本保存年限长、质量差导致NGS检测失败，二次穿刺获取新鲜肿瘤组织难度大，患者接受度低，在InCRPC阶段可以抽取血浆CtDNA进行检测。核酸抽提：针对不同的样本类型，需要使用不同的DNA提取方法和试剂，优先采用中国NMPA批准上市的试剂盒进行DNA提取。DNA的质量控制需要从纯度、浓度及片段化程度进行

34、充分评估。提取后的剩余样本建议长期保存或保留至报告结果产生后按流程销毁。文库构建及质控：文库制备可采用基于扩增子的方法和基于杂交捕获的方法，需考虑适用样本、DNA起始量等因素选择合适的文库制备试剂盒，需从DNA浓度及片段大小等方面对文库进行质控。上机测序：构建好的文库在高通量测序仪上进行上机测序，测序完成后需要对原始数据进行质控，一般参考Q30值，再进行后续的生物信息分析。数据分析：质控后的原始数据常规的分析流程包括数据比对、变异识别、变异注释等，不同类型的变异采用特定的生物信息学分析方法，数据比对、去冗余之后需要对测序深度等检测指标进行质控。变异解读及临床检测报告出具：变异解读是检测结果分析

35、的关键步骤。变异分类建议根据致病性分为5类：5类-致病性、4类-可能治病性、3类-意义未明、2类-可能良性及1类-良性。数据解读标准和规范可参照ACMG及AMP序列变异解读标准和指南（2015版）40o5、GU-MTB2020年版共识专家委员会倡导各单位组建GU-MTB,以进一步规范本中心的基因检测与精准治疗。GUfTB应纳入多学科成员，至少应包括1名熟悉精准医学的肿瘤科医师（基于患者的临床病理学信息发起基因检测需求，熟悉检测信息用于患病风险、预后疗效、靶向治疗等临床场景，并对患者的检测及治疗结果进行跟踪随访）、1名病理科医师（评估患者的肿瘤标本特征并提供符合检测需求的送检样本）、1名经培训的

36、肿瘤遗传咨询医师（对检测结果进行解读和咨询工作，并开展可能的家族患病风险评估和早期干预），以及充分认知相关领域精准医学进展的放射诊断科医师、外科医师、内科医师、核医学科医师和本中心临床试验管理医师（参与精准医学临床试验的设计和开展）。GU-MTB有助于为肿瘤治疗提供更多选项，进一步优化并整合不同的治疗方案，为患者制定更加适宜的以生物标志物引导的临床治疗路径41-42o参考文献GIRIVN,KNUDSENKE,KELLYWK,etal.Roleofgenetictestingforinheritedprostatecancerrisk:PhiIadelphiaProstateCancerCons

37、ensusConference2017J.JClinOncol,2018,36（4）:414-424.叶定伟，朱耀.中国前列腺癌患者基因检测专家共识（2018年版）EJ.中国癌症杂志，2018,28（8）:627-633.YEDW,ZHUY.ExpertconsensusongenetictestinginChineseprostatecancerpatients（2018edition）J.ChinaOncol,2018,28（8）:627-633.叶定伟，朱耀.中国前列腺癌患者基因检测专家共识（2019年版）EJ.中国癌症杂志，2019,29(7):553-560.YEDW,ZHUY.Ch

38、ineseexpertconsensusongenetictestingofprostatecancerpatients(the2019edition)J.ChinaOncol,2019,29(7):553-560.ABIDAW,ARMENIAJ,GOPALANA,etal.ProspectivegenomicprofilingofprostatecanceracrossdiseasestatesrevealsgermlineandsomaticalterationsthatmayaffectclinicaldecisionmakingJ.JCOPrecisOncol,2017,2017:10

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